RefSeq | NC_025132 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | pORI00000621 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 387 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.615 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 401..787 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
AAAGCACCTCTAAATGTTGATAGATAAATCCTACAGTGGATAACTGACGATGTCAAAAAAAAGTCTCGTTAATTGACGGACTTCTCTTGGACAAAATCTCGTCAATAAGCGGACAAAATCTCGTCAATAAGCGGACAAAATCTCGTCAATAAGCGGACAAAATCTCGTTAATAGATTGCTGTATCCATTGCTGCACAAGGATTACAGCACCCCCTAAAGAGGTTTAAAGAGGTTTAAAGAGTATATAAAGAGGGACCCTCAAAAAAAACGAGGTTCTTAGTTTATGCCACATATTATTGACCAAATCCAAGCGTCTTTTGTTGACAAACCTGTACGTACAGGTAAAATAAGCTCTGTAAGTGAAATCGCTTTCTGGAGGGGGAAGAA
AAAGCACCTCTAAATGTTGATAGATAAATCCTACAGTGGATAACTGACGATGTCAAAAAAAAGTCTCGTTAATTGACGGACTTCTCTTGGACAAAATCTCGTCAATAAGCGGACAAAATCTCGTCAATAAGCGGACAAAATCTCGTCAATAAGCGGACAAAATCTCGTTAATAGATTGCTGTATCCATTGCTGCACAAGGATTACAGCACCCCCTAAAGAGGTTTAAAGAGGTTTAAAGAGTATATAAAGAGGGACCCTCAAAAAAAACGAGGTTCTTAGTTTATGCCACATATTATTGACCAAATCCAAGCGTCTTTTGTTGACAAACCTGTACGTACAGGTAAAATAAGCTCTGTAAGTGAAATCGCTTTCTGGAGGGGGAAGAA
AT-rich region
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The information of repeat sequences |
Motif CAAAATCTCGTYAATARRCGG
Motif TAAAGAGG
Motif GCACCYC
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The result of BLAST |
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