RefSeq NC_015912
DoriC accession number pORI00000508
OriC length 2002 nt
OriC AT content 0.7393
The location of oriC region 4965..6966 nt
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OriC map
OriC sequences
TTATTTATCTCCTCATTACTATCTAGATTTATTCTATTTAAGTCATCACTTTTCTCATCTGTTACTACATCATCTAAATTAATATTTTCGTTAAAAGTTAAGGAAATTATCTTAACTTCAATTTTAATTTTTTCTTTTTGCCAATAATTAACACTTATATAAATAATTAGAGAAATTAACGCTGTTAGCACTGTACTTATCTTTACTTCCCTAGGAATAACAAGAAACAATATAAAAGTTAAAACTATAAGTAAAACATGTGTTATAATTTGTTTTCGATCCAAGGATATTTTGTTTATTTTAATACCTAAGTTGGATACGTCTACATCTTCATCATTTTTAAAAGATTTTTTAAAAAAAGGATAGTATCTGATTTGTGTTTTTTCAGTAATCATGTCTTTTATAACTGATTTGGATTTAATTTTATTCTCAAGCTTAACTTTTTTAAAAAAATCTTTTAAAAAAATTGACCCCTCATTTATAATTGTTGCTATGTCTTTATCACTTCTCCAAAAGATTCCTAATCGCATTTGATTATCATCTATATCTCGATAGATTATGTAATGATCTACACCCATATTGACAAATAGAATTTCAGATTCCCCTAGCAAATTTTTACACGACTCTATCAAATCAACATTAGTTTTTATATAGTTTTTAAAATTTTCAACATTTTTAACAAAATATTCACTTGTTTGTCTATAATTATCTATAATTTCATTAATTCTTGAGTTTGAACTTATATCAGATACTTTGAGTATCCTATTAACCACCTCCATATTTATACTCAAAGTTATAATACCTTTTATGAATGCTTTTCCCCCATATTACTCCATCCTATGATAATATCTTTAATAATTTTAATATAAAAAAAAAAAAAAAGAAATAGTAGTAGTCAAAAAATTCAACAATTTGACTATTATTCTTCGAAATATTGATATGAAGACAAATTTTAAGAGTAAAGATTGTATAATTTAAGCACAGTTAAAAGATCCAATTGTAATAACAAATTCAAAAATTATAATATGATTACTAAAAAAATACCAGGTATTGTTGTACCTGATATAAAAGCTTAATGGCGTTTTTTGTGTTTATTAATAGACCTTTTATTACTAATCCAACCCTTAAAAGACCCTGTTGTATACTGACAGCAAGAGCAGAAACAAACTGTATGAATTGATTCATGGTGCTACCTCCTTTCCTTTTTTTAGGATAGGCTTTAACGCCAATATTCATTATATCATACGGTTTTTATCTGATAACAAAAAAATACTACTAGAATGGCCCTTATTTTCTATTTTAAGGACTTTTTTATTTGCTTTTGATCATTTATAAGAAGAATCTCTAAAGTGTCTTAGATGTCGATTTAAGAGCTTGTAAAGGATTATAAAAAACGTTATAATAGAATTATTATAATAACAGTTATTTTCGTGCATGACCGTAAGCATAGCTCCGAGCAAAGCGTAAGGAGTGAGCGTTGGGAATGCACGAACACCCCGAAAAGCTAATGAGGGGGTGTACAAGTGATACAACTTTAACTATCCTAGTGGTGTCAAGGGTGTAGCTTGTATCACTAGTGATACAGAGTAGTGACTAAAATAAAAAAAAAAGAGGACTAAAAATTCCTCTTTTTTTTTTATTTTAAAACGAAAAATATAAGCTTTAGAGATATTTTAACCTTTGTTTCTTCAAAATATTTTTAATTTTAAAAAAAATAAAAAAAGGCGAAGCCTATTATATATTTATCTTATATATTTTAATCTTTTATTCTTTTGCGTCAAAAAAAAGTTAGTATTTTTAAGGGGTTACAGGATAATATAGCATAAAAAAACTGTGTATATAGCATAAAAAAACTGTGTATATAGCATAAAAAAACTGTGTATATAGCATAAAAAAGTCATCAGTTTATGCTATATTATGATATAATAAAAGTATGAAGAACAAACTTTTGAACGAGAATTTCTTCATACTTACTTATGAACACGCAGAGGAGCGTATCTTT
TTATTTATCTCCTCATTACTATCTAGATTTATTCTATTTAAGTCATCACTTTTCTCATCTGTTACTACATCATCTAAATTAATATTTTCGTTAAAAGTTAAGGAAATTATCTTAACTTCAATTTTAATTTTTTCTTTTTGCCAATAATTAACACTTATATAAATAATTAGAGAAATTAACGCTGTTAGCACTGTACTTATCTTTACTTCCCTAGGAATAACAAGAAACAATATAAAAGTTAAAACTATAAGTAAAACATGTGTTATAATTTGTTTTCGATCCAAGGATATTTTGTTTATTTTAATACCTAAGTTGGATACGTCTACATCTTCATCATTTTTAAAAGATTTTTTAAAAAAAGGATAGTATCTGATTTGTGTTTTTTCAGTAATCATGTCTTTTATAACTGATTTGGATTTAATTTTATTCTCAAGCTTAACTTTTTTAAAAAAATCTTTTAAAAAAATTGACCCCTCATTTATAATTGTTGCTATGTCTTTATCACTTCTCCAAAAGATTCCTAATCGCATTTGATTATCATCTATATCTCGATAGATTATGTAATGATCTACACCCATATTGACAAATAGAATTTCAGATTCCCCTAGCAAATTTTTACACGACTCTATCAAATCAACATTAGTTTTTATATAGTTTTTAAAATTTTCAACATTTTTAACAAAATATTCACTTGTTTGTCTATAATTATCTATAATTTCATTAATTCTTGAGTTTGAACTTATATCAGATACTTTGAGTATCCTATTAACCACCTCCATATTTATACTCAAAGTTATAATACCTTTTATGAATGCTTTTCCCCCATATTACTCCATCCTATGATAATATCTTTAATAATTTTAATATAAAAAAAAAAAAAAAGAAATAGTAGTAGTCAAAAAATTCAACAATTTGACTATTATTCTTCGAAATATTGATATGAAGACAAATTTTAAGAGTAAAGATTGTATAATTTAAGCACAGTTAAAAGATCCAATTGTAATAACAAATTCAAAAATTATAATATGATTACTAAAAAAATACCAGGTATTGTTGTACCTGATATAAAAGCTTAATGGCGTTTTTTGTGTTTATTAATAGACCTTTTATTACTAATCCAACCCTTAAAAGACCCTGTTGTATACTGACAGCAAGAGCAGAAACAAACTGTATGAATTGATTCATGGTGCTACCTCCTTTCCTTTTTTTAGGATAGGCTTTAACGCCAATATTCATTATATCATACGGTTTTTATCTGATAACAAAAAAATACTACTAGAATGGCCCTTATTTTCTATTTTAAGGACTTTTTTATTTGCTTTTGATCATTTATAAGAAGAATCTCTAAAGTGTCTTAGATGTCGATTTAAGAGCTTGTAAAGGATTATAAAAAACGTTATAATAGAATTATTATAATAACAGTTATTTTCGTGCATGACCGTAAGCATAGCTCCGAGCAAAGCGTAAGGAGTGAGCGTTGGGAATGCACGAACACCCCGAAAAGCTAATGAGGGGGTGTACAAGTGATACAACTTTAACTATCCTAGTGGTGTCAAGGGTGTAGCTTGTATCACTAGTGATACAGAGTAGTGACTAAAATAAAAAAAAAAGAGGACTAAAAATTCCTCTTTTTTTTTTATTTTAAAACGAAAAATATAAGCTTTAGAGATATTTTAACCTTTGTTTCTTCAAAATATTTTTAATTTTAAAAAAAATAAAAAAAGGCGAAGCCTATTATATATTTATCTTATATATTTTAATCTTTTATTCTTTTGCGTCAAAAAAAAGTTAGTATTTTTAAGGGGTTACAGGATAATATAGCATAAAAAAACTGTGTATATAGCATAAAAAAACTGTGTATATAGCATAAAAAAACTGTGTATATAGCATAAAAAAGTCATCAGTTTATGCTATATTATGATATAATAAAAGTATGAAGAACAAACTTTTGAACGAGAATTTCTTCATACTTACTTATGAACACGCAGAGGAGCGTATCTTT
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif ATAGCATAAAAAAACTGTGTR

StartP-valueSite
18628.80e-12AACTGTGTATATAGCATAAAAAAACTGTGTATATAGCATAA
18408.80e-12AACTGTGTATATAGCATAAAAAAACTGTGTATATAGCATAA
18188.80e-12ACAGGATAATATAGCATAAAAAAACTGTGTATATAGCATAA
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18842.88e-09AACTGTGTATATAGCATAAAAAAGTCATCAGTTTATGCTAT

Motif KAACWCSSAGAAAAGCK

StartP-valueSite
19791.94e-11ACTTACTTATGAACACGCAGAGGAGCGTATCTTT
14902.32e-10GGGAATGCACGAACACCCCGAAAAGCTAATGAGGGGG
14485.68e-10ACCGTAAGCATAGCTCCGAGCAAAGCGTAAGGAGTGA

Motif GGGTGTAMAGG

StartP-valueSite
18022.46e-07GTATTTTTAAGGGGTTACAGGATAATATAGC
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15488.12e-07ACTATCCTAGTGGTGTCAAGGGTGTAGCTTG
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The result of BLAST Download

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