RefSeq NC_001923
DoriC accession number pORI00000358
OriC length 2390 nt
OriC AT content 0.8021
The location of oriC region 2626..0 nt
Browse in NCBI
OriC map
OriC sequences
TTGTAATAAATAAAATAAAATAAAATTGATTTAAAAATTGATTTAAAAATTGATATAAAAAAAAGATATTATATATATATATATAAAGAAATGCAAAGAATAAGACAATTAAATTATAAAATACTTTACAAGGTTTTTGTTGAGTATGCAGTACCATCCTGCACTGTTGCCAAAGATGCAATGGATAAAGTTGATAAAGATAATGAAAGAAAACATATTGAGAATAACCTAAAAACATCTTGTCAGATAAAAAAATCAAATATCTTTAAGTAATGAATGATAAAACATATATATTTGTACTCCTTGAGTTAAACGGAGTACAACCATACTAAAATTTTTAAAAATAGATGATATTTGAAAGTTTTATATATATATATATATATATATATATTATAATATAAATTAATATGGCTATTAGCTAGTTAATAACTAAGTATTTTATATGTAAAAAACTATACTTTTTATAATATATACCAAATATTATAAAAATGGTATATATTTGTAGAACTTTTTATTTGATGACGAATGACATGTTTTTTATTAAACGCCGATGTAGTTTGGAATAGAAAATAGTAAAAGAAGAAAAAAAAAAAACTAATTAGTCTGACTAATTTCTCATTTTTTTATAATATATACCAAATGTTATAAAAATAGTATACATTTGTAGAACTTTTTATTTTATGACGAATGACATGTTTTTTATTAAACGCCGATGTAGTTTGGAATAGAAAATAGTTAAAGAAGAAAAAAAAAAAACTAATTAGTCTGACTAATTTCTCATTTTTTTATAATATATACCAAATGTTATAAAAATAGTATACATTTGTAGAACTTTTTATTTTATGACGAATGACATGTTTTTTATTAAACGCCGATGTAGTTTGGAATAGAAAATAGTAAAAGAAGAAAAAAAAAAAACTAATTAGTCTGACTAATTTCTCATTTTTTTATAATATATACCAAATGTTATAAAAATAGTATACATTTGTAGAACTTTTTATTTTATGACGAATGACATGTTTTTTATTAAACGCCGATGTAGTTTGAAAAAAAAAATTGTAAAAGAAGAAAAAAAAAAACCGAAAAAATTAAAAAAAAAAACAATTTGGTCATAAAACCCTTATATCACATCCGTTTTTAATAAAAATTATGTATTTGTTTCTAACTTTTAATTTTGAACATAGATCTTTCATTTAGATTAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAGTTTTTTTTTATTTTAATTTATTTTTTAATATGGGGTTGTTACATAAAACATAGTTATAATTATTTTAAAAAAAAAAAGTTAGAATATATTTTAAATATAACATAAAGGGTACCAATGTGTTCACAATCGAAAGATAAACACATATATATAAGAATTATTAAAGGACATTATCATCTGAGGTCATAAACATACTCTGGAAAATTTAAAAAAATAGGTCATCCTAGGCAGGCCTGTAGGATGACTAAAAAATCAGAATTTTATAATATGTTCAGAATATTATAAATATGGTATATATAGATAGACAATGCAAAGTTAAGTAAAACGACACCATTTTTATTAAATGCGAGTGAGATTAAAGCCGATACTAAGTATTGACTAAAAAAAAAAAAAATTAAAATTTTTTTAATTTTTTTTTTTTTTTACCTATCCTCAATTATTAGTCAAATGACCACCGGATTTAATAAAAATGGTGTCGTTTTACTTAACTTTGCATTGTCTATCTATATATACCATATTTATAATATTCTGAACATATTATAAAATTCTGATTTTTTAGTCATCCTACAGGCCTGCCTAGGATGACCTATTTTTTTAAATTTTCCAGAGTATGTTTATGACCTCAGATGATAATGTCCTTTAATAATTCTTATATATATGTGTTTATCTTTCGATTGTGAACACATTGGTACCCTTTATGTTATATTTAAAATATATTCTAACTTTTTTTTTTTAAAATAATTATAATTATGTTTTATATGACAACCCACACTATATTAAAAAAAAATTTTAAAACTTTTTTTTTTTTTTTCATTTTTTCATAACATATATAGCATAGATAGATTCAAAATTAAAAGTTATGGACATATACATAATTTTTATTAAAAACGGATGTGATATAAGAGTTTTCTAAACAAGTTGTTTTTTTTGAAAAAGGATGCCTTTTTTTATTTTTTTTTTATAATTTTTTTTTATTTTTTTTTTTAACACCGATTTTTTTTTTATTTTTTTTTATTTTTTTTATTTTTTGTTTTATTGTTCTTTTTATTTTTTATTTTATTAACACACACCACTTTTTTTTACATTAACACATATTTTATATTATAATTCATAAAAATACAAATAAAAATACAAATAAAAATACAAATAAAAATACAAATAAAAATA
TTGTAATAAATAAAATAAAATAAAATTGATTTAAAAATTGATTTAAAAATTGATATAAAAAAAAGATATTATATATATATATATAAAGAAATGCAAAGAATAAGACAATTAAATTATAAAATACTTTACAAGGTTTTTGTTGAGTATGCAGTACCATCCTGCACTGTTGCCAAAGATGCAATGGATAAAGTTGATAAAGATAATGAAAGAAAACATATTGAGAATAACCTAAAAACATCTTGTCAGATAAAAAAATCAAATATCTTTAAGTAATGAATGATAAAACATATATATTTGTACTCCTTGAGTTAAACGGAGTACAACCATACTAAAATTTTTAAAAATAGATGATATTTGAAAGTTTTATATATATATATATATATATATATATTATAATATAAATTAATATGGCTATTAGCTAGTTAATAACTAAGTATTTTATATGTAAAAAACTATACTTTTTATAATATATACCAAATATTATAAAAATGGTATATATTTGTAGAACTTTTTATTTGATGACGAATGACATGTTTTTTATTAAACGCCGATGTAGTTTGGAATAGAAAATAGTAAAAGAAGAAAAAAAAAAAACTAATTAGTCTGACTAATTTCTCATTTTTTTATAATATATACCAAATGTTATAAAAATAGTATACATTTGTAGAACTTTTTATTTTATGACGAATGACATGTTTTTTATTAAACGCCGATGTAGTTTGGAATAGAAAATAGTTAAAGAAGAAAAAAAAAAAACTAATTAGTCTGACTAATTTCTCATTTTTTTATAATATATACCAAATGTTATAAAAATAGTATACATTTGTAGAACTTTTTATTTTATGACGAATGACATGTTTTTTATTAAACGCCGATGTAGTTTGGAATAGAAAATAGTAAAAGAAGAAAAAAAAAAAACTAATTAGTCTGACTAATTTCTCATTTTTTTATAATATATACCAAATGTTATAAAAATAGTATACATTTGTAGAACTTTTTATTTTATGACGAATGACATGTTTTTTATTAAACGCCGATGTAGTTTGAAAAAAAAAATTGTAAAAGAAGAAAAAAAAAAACCGAAAAAATTAAAAAAAAAAACAATTTGGTCATAAAACCCTTATATCACATCCGTTTTTAATAAAAATTATGTATTTGTTTCTAACTTTTAATTTTGAACATAGATCTTTCATTTAGATTAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAGTTTTTTTTTATTTTAATTTATTTTTTAATATGGGGTTGTTACATAAAACATAGTTATAATTATTTTAAAAAAAAAAAGTTAGAATATATTTTAAATATAACATAAAGGGTACCAATGTGTTCACAATCGAAAGATAAACACATATATATAAGAATTATTAAAGGACATTATCATCTGAGGTCATAAACATACTCTGGAAAATTTAAAAAAATAGGTCATCCTAGGCAGGCCTGTAGGATGACTAAAAAATCAGAATTTTATAATATGTTCAGAATATTATAAATATGGTATATATAGATAGACAATGCAAAGTTAAGTAAAACGACACCATTTTTATTAAATGCGAGTGAGATTAAAGCCGATACTAAGTATTGACTAAAAAAAAAAAAAATTAAAATTTTTTTAATTTTTTTTTTTTTTTACCTATCCTCAATTATTAGTCAAATGACCACCGGATTTAATAAAAATGGTGTCGTTTTACTTAACTTTGCATTGTCTATCTATATATACCATATTTATAATATTCTGAACATATTATAAAATTCTGATTTTTTAGTCATCCTACAGGCCTGCCTAGGATGACCTATTTTTTTAAATTTTCCAGAGTATGTTTATGACCTCAGATGATAATGTCCTTTAATAATTCTTATATATATGTGTTTATCTTTCGATTGTGAACACATTGGTACCCTTTATGTTATATTTAAAATATATTCTAACTTTTTTTTTTTAAAATAATTATAATTATGTTTTATATGACAACCCACACTATATTAAAAAAAAATTTTAAAACTTTTTTTTTTTTTTTCATTTTTTCATAACATATATAGCATAGATAGATTCAAAATTAAAAGTTATGGACATATACATAATTTTTATTAAAAACGGATGTGATATAAGAGTTTTCTAAACAAGTTGTTTTTTTTGAAAAAGGATGCCTTTTTTTATTTTTTTTTTATAATTTTTTTTTATTTTTTTTTTTAACACCGATTTTTTTTTTATTTTTTTTTATTTTTTTTATTTTTTGTTTTATTGTTCTTTTTATTTTTTATTTTATTAACACACACCACTTTTTTTTACATTAACACATATTTTATATTATAATTCATAAAAATACAAATAAAAATACAAATAAAAATACAAATAAAAATACAAATAAAAATA
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif GAACTTTTTATTTTATGACGAATGACATGTTTTTTATTAAACGCCGATG

StartP-valueSite
9913.18e-28TACATTTGTAGAACTTTTTATTTTATGACGAATGACATGTTTTTTATTAAACGCCGATGTAGTTTGAAA
8293.18e-28TACATTTGTAGAACTTTTTATTTTATGACGAATGACATGTTTTTTATTAAACGCCGATGTAGTTTGGAA
6673.18e-28TACATTTGTAGAACTTTTTATTTTATGACGAATGACATGTTTTTTATTAAACGCCGATGTAGTTTGGAA
5055.09e-28TATATTTGTAGAACTTTTTATTTGATGACGAATGACATGTTTTTTATTAAACGCCGATGTAGTTTGGAA
15271.21e-19TATATAGATAGACAATGCAAAGTTAAGTAAAACGACACCATTTTTATTAAATGCGAGTGAGATTAAAGC

Motif CTMWTTTTTTTATAATATATACCAAATGTTATAAAAATRGTATACATTTG

StartP-valueSite
9392.36e-24TGACTAATTTCTCATTTTTTTATAATATATACCAAATGTTATAAAAATAGTATACATTTGTAGAACTTTT
7772.36e-24TGACTAATTTCTCATTTTTTTATAATATATACCAAATGTTATAAAAATAGTATACATTTGTAGAACTTTT
6152.36e-24TGACTAATTTCTCATTTTTTTATAATATATACCAAATGTTATAAAAATAGTATACATTTGTAGAACTTTT
4532.82e-20ATGTAAAAAACTATACTTTTTATAATATATACCAAATATTATAAAAATGGTATATATTTGTAGAACTTTT
16571.33e-17TACCTATCCTCAATTATTAGTCAAATGACCACCGGATTTAATAAAAATGGTGTCGTTTTACTTAACTTTG

Motif AGTTTGGAATAGAAAATWGTAAAAGAAGAAAAAAAAAAAACKAAWWAGTY

StartP-valueSite
8791.82e-24ACGCCGATGTAGTTTGGAATAGAAAATAGTAAAAGAAGAAAAAAAAAAAACTAATTAGTCTGACTAATTT
5551.82e-24ACGCCGATGTAGTTTGGAATAGAAAATAGTAAAAGAAGAAAAAAAAAAAACTAATTAGTCTGACTAATTT
7173.01e-23ACGCCGATGTAGTTTGGAATAGAAAATAGTTAAAGAAGAAAAAAAAAAAACTAATTAGTCTGACTAATTT
10411.03e-18ACGCCGATGTAGTTTGAAAAAAAAAATTGTAAAAGAAGAAAAAAAAAAACCGAAAAAATTAAAAAAAAAA
1431.15e-16GTTTTTGTTGAGTATGCAGTACCATCCTGCACTGTTGCCAAAGATGCAATGGATAAAGTTGATAAAGATA
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
pORI00000358 100.0 2390 0 0 1 2390 1 2390 0.0 4414
pORI00000358 87.425 1169 107 28 1048 2196 2196 1048 0.0 1308
pORI00000358 97.821 459 10 0 621 1079 459 917 0.0 793
pORI00000358 97.821 459 10 0 459 917 621 1079 0.0 793
pORI00000358 96.97 297 9 0 783 1079 459 755 0.0 499
pORI00000358 96.97 297 9 0 459 755 783 1079 0.0 499
pORI00000358 94.074 135 8 0 945 1079 459 593 0.0 206
pORI00000358 94.074 135 8 0 459 593 945 1079 0.0 206
pORI00000354 84.831 1602 198 32 783 2365 286 1861 0.0 1570
pORI00000354 82.363 1117 171 22 1095 2196 1656 551 0.0 948