RefSeq NC_001888
DoriC accession number pORI00000354
OriC length 1862 nt
OriC AT content 0.8013
The location of oriC region 2620..0 nt
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OriC map
OriC sequences
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TTATAATAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATAATAAAGTTAATTTTTGATAATATCAAAATAAATATTTTTTAATTGTTTGCAAAATGTTATAAAACTGGCGTATATATACTTAAAATTGAATTTGGAACAAAACCATACTATATTTATTAATAATGGTTAATGTTTTAATAAAAATTTTTAGTATAAAAATTTTGATAATAACCATATAAAATTAATATGGTATTAGCTCGTTAATAACACGTTATTAACTAAGTATTTTATATGTAAGAAAAGTATACTTTTTATAATGTTTACCAAATGTTATAAAAATGGTATATATTTGTAGAACTTTTTATTTAATGACGAATGACATGTTTTTTATTTAACGCCGATGTAGTCTGGAAGAAAAAATAGTAAAAGAAGAAAAAAAAAAAATCATTTCGTCTGACTAATTTATGATGTTTTTATAATGTTTACCAAATATTATAAAAATGGTATATATTTGTAGAACTTTTCATTTCATGACGAATTATATGTTTTTTATTAAACGCCGATGTATTTTGAAAATAAAAAATTGTAAAAGAAGAAAAAAAAAAAACCGAAAAATTAAAAAAAAAACAATTTGATCATAAAACCCTTATATCACATCCGTTTTTAATAAAAATTATGTATTTGTTCCTAACTTTTAATTCTGTACATAGATCTTTCATTTAGATTAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAATTTTTTTATTTATTTTTTTAAATTAGTATGGGGTTATCACATAAAACAAAGTTATAATTTTTTTTAAAAAAAAAAGTTATAATATTTTTCAAATATCACATAAATGGTATCAATGTGTTCACAATCGCAAGATAAACACATATATATAAGAATTATTAAAGGTCATTGTAATCTGAGGTCATAAACAAACTTTGAAAGTTTTGAAAAAACTGGGAATCCTAGGCAGGTCTGAAGGATTCCCAAAAAATCAAAATTTTATAATATGTTCAGAAGACTATAAGTCGGGTATAGATCGATAGATAATGAAAAGTTATGCAAATCTACACTACTTTTATTAAAGTAGGAGGTCATTTGATTAGTAACTGAGGGTGTGTAAAAAAAAAAAAAATTTGTAAAAAATTTTAATTTTTTTTTTTTCCATCCTGAAATTAATAACAGCTTTAATCTTAACCTCCTTTAATAAAAGTAGTGTAGATTTGCATAACTTTTCATTATCTATCGATCTATACCCGACTTATAGTCTTCTGAACATATTATAAAATTTTGATTTTTTGGGAATCCTTCAGGCCTGCCTAGGATTCCCAGTTTTTTCAAAACTTTCAAAGTTTGTTTATGACCTCAGATTACAATGACCTTTAATAATTCTTATATATATGTGTTTATCTTGCGATTGTGAACACATTGATACCATTTATGTGATATTTGAAAAATATTATAACTTTTTTTTTTAAAAAAAATTATAACTTTGTTTTATATGACAACCCACATTATATTAAAAAAAAATATTAAAACTTTTTTTTTTTTTTTTCATTATTTTTTAATGTAAATAGCATATATAGATTCAGAATTAAAAGTTAGGAACGAATACATAATTTTTATTAAAAACGGATGTGATATAAGGGTTTTATGATCAAGTTGTTTTTTTAAAAAAAGGATGACTTTTTTATTTTTTTTAATATTATTTTTTTTATTTTTTTTTTTTTAACACCAATTTTTTTTTTATTTTTTTTTTTTTTATTTTATTTTTTATTTTATTTTTATTTTCTTAACACACACACAATATTTTTACATTCACACATTATATTCATATTTTTATTCATACTATTATTCATAAAAATATATAAAAAAATT
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif AATGTTTACMAAATDTTATAAAAMTGGTRTAKATTTRYAKAAMWTTTHA

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Motif KTWATGAMVAAWTACATDWTTTTTATTAAAVDCSGATGTAWTWTGA

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Motif GGGAATCCTWSRSRSSTSYSWAGGATTCCC

StartP-valueSite
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The result of BLAST Download

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