RefSeq NC_013315.1
Accession number NC_013315.1
DoriC accession number ORI93010591
OriC length 658 nt
OriC AT content 0.797872
The location of oriC region 4109897..4110554 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif SGGASG

StartP-valueSite
6456.86e-06TTATTCTGTTCGGAGGTTTATATT
1196.86e-06ACGAGTTTTTGGGACGCTTATATCAC

Motif GTGGATAA

StartP-valueSite
2855.81e-06AGTTAATATTGTGGATAAATTAGTTACA
3987.76e-06TTCACAGCTTGTGGATACTTTTGTGTAT
6211.21e-05TAATAACTTTGTGGAAAATATTAATTAT
3562.11e-05TGTTGATAATGTGCATAAATGTTATCAA
3475.89e-05AAATATACTTGTTGATAATGTGCATAAA

Motif CACMGC

StartP-valueSite
85.31e-06TATTTTGCACCGCCTTTCAGATT
3902.11e-05AGAAATTATTCACAGCTTGTGGATAC

Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI93010593 100.0 658 0 0 1 658 1 658 0.0 1216
ORI93010591 100.0 658 0 0 1 658 1 658 0.0 1216