RefSeq NZ_CP017803.1
DoriC accession number aORI10010310
OriC length 938 nt
OriC AT content 0.1525
The location of oriC region 1722023..1722960 nt
Browse in NCBI
OriC map
OriC sequences
ATGTTCACCATTTTTAAAAAAGTAATAAAAAAATAATCTTAAAAACATGAAAAAATCATAAGTATTATTTCCAGTGATAATATATGAAAATAGTGTTAAATAAAGGTTTGTATTACAAAATTGTATTGAAATAATAAATTTTATTACAAAATAAAAAATAAAAACATTTAAATAAATTAAAATTAACTAAAAAATGTTTAAAATAATTTAATCTATAAAAAACAGATAATTAATAGATTAAATAAAAATTAAAATGAATATGATTAGTTAAAATTAAAACATGAAAAATAACCATTTCAAATATAAAGACATAAATTTCAAGTGAAAAAAGAGTAATAAAAATAGAATTAATATAATCATAAAATAAATTTACAATTTTTAAATTATAAAATAAAAACAGTAAATTAAATATTTTTAAAAAATAAGAAGTTTAAAACAATTTTTTATAAAATAAATTAATTTGAAAATTTTTTAAAAAAAATAAAAACAATAAAAATAAAGCTAAAACAAATATTATTTCAAAATTAAAGAAGATAAGTTTCAATTGTAATAAATTCAGTTAAATATAATATTTATCTGAGCATTTGAAAAATAAAACATACATTTCAAGTGAAAAAAAATCTGAAAAAGGATTTAATAAAAAAATTTATAATGATTTATCATAAAAAGTGAGAGATAAATTTCAAGTGTAATGCAATTTTTAGCAGGAAGCAAAAATCAAGACATAAATTTCAAGTGAAAAAAAAATTTAAAATGAATTAAAAAAGTTATTTCAGTAAAAAAAGAATGAAAAATGTTTTATTTTAAATTTTAACCAATAAAAAATAAGATAAATTTCAAATATTTTTACAGATGAAATACATGTCTTCATTCCTACAGAACCTTCGCAGAGCTTTCACTTGAAATTAATGTCTGTCTGTCTAAAATTTATAAAAAAA
ATGTTCACCATTTTTAAAAAAGTAATAAAAAAATAATCTTAAAAACATGAAAAAATCATAAGTATTATTTCCAGTGATAATATATGAAAATAGTGTTAAATAAAGGTTTGTATTACAAAATTGTATTGAAATAATAAATTTTATTACAAAATAAAAAATAAAAACATTTAAATAAATTAAAATTAACTAAAAAATGTTTAAAATAATTTAATCTATAAAAAACAGATAATTAATAGATTAAATAAAAATTAAAATGAATATGATTAGTTAAAATTAAAACATGAAAAATAACCATTTCAAATATAAAGACATAAATTTCAAGTGAAAAAAGAGTAATAAAAATAGAATTAATATAATCATAAAATAAATTTACAATTTTTAAATTATAAAATAAAAACAGTAAATTAAATATTTTTAAAAAATAAGAAGTTTAAAACAATTTTTTATAAAATAAATTAATTTGAAAATTTTTTAAAAAAAATAAAAACAATAAAAATAAAGCTAAAACAAATATTATTTCAAAATTAAAGAAGATAAGTTTCAATTGTAATAAATTCAGTTAAATATAATATTTATCTGAGCATTTGAAAAATAAAACATACATTTCAAGTGAAAAAAAATCTGAAAAAGGATTTAATAAAAAAATTTATAATGATTTATCATAAAAAGTGAGAGATAAATTTCAAGTGTAATGCAATTTTTAGCAGGAAGCAAAAATCAAGACATAAATTTCAAGTGAAAAAAAAATTTAAAATGAATTAAAAAAGTTATTTCAGTAAAAAAAGAATGAAAAATGTTTTATTTTAAATTTTAACCAATAAAAAATAAGATAAATTTCAAATATTTTTACAGATGAAATACATGTCTTCATTCCTACAGAACCTTCGCAGAGCTTTCACTTGAAATTAATGTCTGTCTGTCTAAAATTTATAAAAAAA
ATGTTCACCATTTTTAAAAAAGTAATAAAAAAATAATCTTAAAAACATGAAAAAATCATAAGTATTATTTCCAGTGATAATATATGAAAATAGTGTTAAATAAAGGTTTGTATTACAAAATTGTATTGAAATAATAAATTTTATTACAAAATAAAAAATAAAAACATTTAAATAAATTAAAATTAACTAAAAAATGTTTAAAATAATTTAATCTATAAAAAACAGATAATTAATAGATTAAATAAAAATTAAAATGAATATGATTAGTTAAAATTAAAACATGAAAAATAACCATTTCAAATATAAAGACATAAATTTCAAGTGAAAAAAGAGTAATAAAAATAGAATTAATATAATCATAAAATAAATTTACAATTTTTAAATTATAAAATAAAAACAGTAAATTAAATATTTTTAAAAAATAAGAAGTTTAAAACAATTTTTTATAAAATAAATTAATTTGAAAATTTTTTAAAAAAAATAAAAACAATAAAAATAAAGCTAAAACAAATATTATTTCAAAATTAAAGAAGATAAGTTTCAATTGTAATAAATTCAGTTAAATATAATATTTATCTGAGCATTTGAAAAATAAAACATACATTTCAAGTGAAAAAAAATCTGAAAAAGGATTTAATAAAAAAATTTATAATGATTTATCATAAAAAGTGAGAGATAAATTTCAAGTGTAATGCAATTTTTAGCAGGAAGCAAAAATCAAGACATAAATTTCAAGTGAAAAAAAAATTTAAAATGAATTAAAAAAGTTATTTCAGTAAAAAAAGAATGAAAAATGTTTTATTTTAAATTTTAACCAATAAAAAATAAGATAAATTTCAAATATTTTTACAGATGAAATACATGTCTTCATTCCTACAGAACCTTCGCAGAGCTTTCACTTGAAATTAATGTCTGTCTGTCTAAAATTTATAAAAAAA

ORB     AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif GACATAAATTTCAAGTG

StartP-valueSite
7223.07e-10CAAAAATCAAGACATAAATTTCAAGTGAAAAAAAAAT
3083.07e-10CAAATATAAAGACATAAATTTCAAGTGAAAAAAGAGT
8867.00e-10ACAGAACCTTCGCAGAGCTTTCACTTGAAATTAATGT
6731.07e-09TAAAAAGTGAGAGATAAATTTCAAGTGTAATGCAATT
5961.65e-09TGAAAAATAAAACATACATTTCAAGTGAAAAAAAATC

Motif TGTBTGYATTWC

StartP-valueSite
9107.54e-09TTGAAATTAATGTCTGTCTGTCTAAAATTTAT
8636.37e-08ATGAAATACATGTCTTCATTCCTACAGAACCT
5761.39e-06ATAATATTTATCTGAGCATTTGAAAAATAAAA
1051.39e-06GTTAAATAAAGGTTTGTATTACAAAATTGTAT

Motif CCATTTY

StartP-valueSite
2925.98e-06TGAAAAATAACCATTTCAAATATAAAG
83.34e-05ATGTTCACCATTTTTAAAAAAGTA

The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
aORI10010310 100.0 938 0 0 1 938 1 938 0.0 1733
aORI10010045 96.603 942 25 4 1 938 1 939 0.0 1555