RefSeq NC_009515.1
DoriC accession number aORI10010045
OriC length 939 nt
OriC AT content 0.8413
The location of oriC region 1269631..1270569 nt
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OriC map
OriC sequences
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ATGTTCACCATTTTAAAAAGTAATAAAAAAATAATCTTAAAAACATGAAAAAATCATAAGTATTATTTCCAGTGATAATATATGAAAACAGTGTTAAATAAAGGTTTGTATTACAAAATTGTATTGAAATAATAAATTTTATTATAAAATAAAAAATAAAAACATTTAAATAAATTAAAATTAACTAAAAAATGTTTAAAATAATTTAATCTATAAAAAACAAATAATTAATAGATTAAATAAAAATTAAAGTGAATATGATTAGTTAAAATTAAAACATGAAAAATAACTATTTCAAATATAAAGACATATATTTCAAGTGAAAAAAGAGTAATAAAAATAGAATTAATATAATCATAAAATAAATTTACAATTTTTAAATTATAAAATAAAAACAGCAAATTAAATATTTTTAAAAAATAAGAAGTTTAAAACAATTTTTTATAAAATAAATTATTTTAAAAATTTTTTAAAAAAATAAAAACAATAAAAATAAAGCTAAAACAATTTTTATTTCAAAATTAAAGAAGATAAATTTCAATTGTAATAATTTCAGTTAAATATAATATTTATCTGAGCATTTGAAAAATAAAACATATATTTCAAGTGAAAAAAAATCTGAAAAAGGATTTAATAAAAAAATTTATAATGATTTATCATAAAAAGTGAGAGATAAATTTCAAGTGTAATGCAATTTTTAGCGGGAAGCAAAAATCAAGACATTGATTTCAAGTGAAAAAAAATTTTAAAATGAATTAAAAAAGTTATTTCAGTAAAAAAAGAATGGAAAATGTTTTATTTTAAATTTAAACCAAGAAAAATTAAGATAAATTTCAAGTGTTTTTACAGATGAAATACATGTCTTCATTCCTACAGAACCTTCGCAGAGCTTTCACTTGAAATTCATGTCTGTCTGTCTGTCTAAAATTTATAAAAAAA
ATGTTCACCATTTTAAAAAGTAATAAAAAAATAATCTTAAAAACATGAAAAAATCATAAGTATTATTTCCAGTGATAATATATGAAAACAGTGTTAAATAAAGGTTTGTATTACAAAATTGTATTGAAATAATAAATTTTATTATAAAATAAAAAATAAAAACATTTAAATAAATTAAAATTAACTAAAAAATGTTTAAAATAATTTAATCTATAAAAAACAAATAATTAATAGATTAAATAAAAATTAAAGTGAATATGATTAGTTAAAATTAAAACATGAAAAATAACTATTTCAAATATAAAGACATATATTTCAAGTGAAAAAAGAGTAATAAAAATAGAATTAATATAATCATAAAATAAATTTACAATTTTTAAATTATAAAATAAAAACAGCAAATTAAATATTTTTAAAAAATAAGAAGTTTAAAACAATTTTTTATAAAATAAATTATTTTAAAAATTTTTTAAAAAAATAAAAACAATAAAAATAAAGCTAAAACAATTTTTATTTCAAAATTAAAGAAGATAAATTTCAATTGTAATAATTTCAGTTAAATATAATATTTATCTGAGCATTTGAAAAATAAAACATATATTTCAAGTGAAAAAAAATCTGAAAAAGGATTTAATAAAAAAATTTATAATGATTTATCATAAAAAGTGAGAGATAAATTTCAAGTGTAATGCAATTTTTAGCGGGAAGCAAAAATCAAGACATTGATTTCAAGTGAAAAAAAATTTTAAAATGAATTAAAAAAGTTATTTCAGTAAAAAAAGAATGGAAAATGTTTTATTTTAAATTTAAACCAAGAAAAATTAAGATAAATTTCAAGTGTTTTTACAGATGAAATACATGTCTTCATTCCTACAGAACCTTCGCAGAGCTTTCACTTGAAATTCATGTCTGTCTGTCTGTCTAAAATTTATAAAAAAA
ORB     AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif GACATADATTTCAAGTG

StartP-valueSite
7191.35e-10CAAAAATCAAGACATTGATTTCAAGTGAAAAAAAATT
3062.77e-10CAAATATAAAGACATATATTTCAAGTGAAAAAAGAGT
8835.61e-10ACAGAACCTTCGCAGAGCTTTCACTTGAAATTCATGT
6703.96e-09TAAAAAGTGAGAGATAAATTTCAAGTGTAATGCAATT
5934.73e-09TGAAAAATAAAACATATATTTCAAGTGAAAAAAAATC

Motif CATGTCTKYMTKYCTRY

StartP-valueSite
9052.33e-12ACTTGAAATTCATGTCTGTCTGTCTGTCTAAAATTTA
8581.79e-11AGATGAAATACATGTCTTCATTCCTACAGAACCTTCG

Motif TTTCAAKTG

StartP-valueSite
662.40e-07ATAAGTATTATTTCCAGTGATAATATATG
8321.96e-06TTAAGATAAATTTCAAGTGTTTTTACAGA
5369.22e-06AGAAGATAAATTTCAATTGTAATAATTTC
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
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