RefSeq NC_008212.1
DoriC accession number aORI10010130
OriC length 947 nt
OriC AT content 0.5882
The location of oriC region 3132270..722 nt
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OriC map
OriC sequences
CCTGTCCTCCCACGCCTCTTGAGTGGTACCAACTGTCCCGAAGTGGCGTATGGCGGTATCACGTTGTTGTGGTCACTTAAAACCGCGTCAGACATCAACATAGAATATGACATCCAAGAATTCCCCGCTCAAAATTATATCTAGCATCTGGCATCTTAGGTCTAGCCTTGATGAATATAGTGGATAGCACTATTGCACTTGTTTTCACGGGTAATTGATATTAACAAATCGGTTTCGATTGATAATATCCGTTTGATACTCGGTTATGCCGTGTGCCCCCCACCCCTCTGTTTCAGGTGGAGATGCTAAGAAGTGTGTGCGGTTACTCACTAGTCGAGATATTGTGACAATCTTCTAACTCTTTATACTTAATTACAACATAATATACGATGTACATAACTACTAAGTTGCAGTACGGGTATTGTTATATAGTATATTATATAAAGCTTTGCTCATTAATACTGTATATAATCGAACACCCACCCCCTTGTGATTACAGTTCCAGTTGAAACAAAGGGGTTGGGGGGTATTGTATTTGATACAGCGAACAGAAAATGCCACTATCATTCCTAAGTGATGATCCCGCTGACCGGGTGGATGGATACATCATATCGATTATCTGAGTATCTTAAGAATCTGTCAGACCAAACTTGCGTTCAATAGGTAGGTGTATCATTGTGACATATTCACTCGACTCTCGACTCTCGACTATGTTGGTTTGTTGCATCTTATACCTCACAGGGATGTTAGTATGGTCGTAACTACAAGAGATAGATTTTTGTATCGTGCACTCATCGATTTCCATTGCATCAATTGTATATCGGTCTAATTGATCAAAGCAATATATTGACCGTTTCAATACCTAAACCCGCCTCATTTGGACGCTGTCATTGGAATTTCCACCTGAAATCAAGGGGATGTAGACGGGTGGACGGGGGAATTACCAA
CCTGTCCTCCCACGCCTCTTGAGTGGTACCAACTGTCCCGAAGTGGCGTATGGCGGTATCACGTTGTTGTGGTCACTTAAAACCGCGTCAGACATCAACATAGAATATGACATCCAAGAATTCCCCGCTCAAAATTATATCTAGCATCTGGCATCTTAGGTCTAGCCTTGATGAATATAGTGGATAGCACTATTGCACTTGTTTTCACGGGTAATTGATATTAACAAATCGGTTTCGATTGATAATATCCGTTTGATACTCGGTTATGCCGTGTGCCCCCCACCCCTCTGTTTCAGGTGGAGATGCTAAGAAGTGTGTGCGGTTACTCACTAGTCGAGATATTGTGACAATCTTCTAACTCTTTATACTTAATTACAACATAATATACGATGTACATAACTACTAAGTTGCAGTACGGGTATTGTTATATAGTATATTATATAAAGCTTTGCTCATTAATACTGTATATAATCGAACACCCACCCCCTTGTGATTACAGTTCCAGTTGAAACAAAGGGGTTGGGGGGTATTGTATTTGATACAGCGAACAGAAAATGCCACTATCATTCCTAAGTGATGATCCCGCTGACCGGGTGGATGGATACATCATATCGATTATCTGAGTATCTTAAGAATCTGTCAGACCAAACTTGCGTTCAATAGGTAGGTGTATCATTGTGACATATTCACTCGACTCTCGACTCTCGACTATGTTGGTTTGTTGCATCTTATACCTCACAGGGATGTTAGTATGGTCGTAACTACAAGAGATAGATTTTTGTATCGTGCACTCATCGATTTCCATTGCATCAATTGTATATCGGTCTAATTGATCAAAGCAATATATTGACCGTTTCAATACCTAAACCCGCCTCATTTGGACGCTGTCATTGGAATTTCCACCTGAAATCAAGGGGATGTAGACGGGTGGACGGGGGAATTACCAA
CCTGTCCTCCCACGCCTCTTGAGTGGTACCAACTGTCCCGAAGTGGCGTATGGCGGTATCACGTTGTTGTGGTCACTTAAAACCGCGTCAGACATCAACATAGAATATGACATCCAAGAATTCCCCGCTCAAAATTATATCTAGCATCTGGCATCTTAGGTCTAGCCTTGATGAATATAGTGGATAGCACTATTGCACTTGTTTTCACGGGTAATTGATATTAACAAATCGGTTTCGATTGATAATATCCGTTTGATACTCGGTTATGCCGTGTGCCCCCCACCCCTCTGTTTCAGGTGGAGATGCTAAGAAGTGTGTGCGGTTACTCACTAGTCGAGATATTGTGACAATCTTCTAACTCTTTATACTTAATTACAACATAATATACGATGTACATAACTACTAAGTTGCAGTACGGGTATTGTTATATAGTATATTATATAAAGCTTTGCTCATTAATACTGTATATAATCGAACACCCACCCCCTTGTGATTACAGTTCCAGTTGAAACAAAGGGGTTGGGGGGTATTGTATTTGATACAGCGAACAGAAAATGCCACTATCATTCCTAAGTGATGATCCCGCTGACCGGGTGGATGGATACATCATATCGATTATCTGAGTATCTTAAGAATCTGTCAGACCAAACTTGCGTTCAATAGGTAGGTGTATCATTGTGACATATTCACTCGACTCTCGACTCTCGACTATGTTGGTTTGTTGCATCTTATACCTCACAGGGATGTTAGTATGGTCGTAACTACAAGAGATAGATTTTTGTATCGTGCACTCATCGATTTCCATTGCATCAATTGTATATCGGTCTAATTGATCAAAGCAATATATTGACCGTTTCAATACCTAAACCCGCCTCATTTGGACGCTGTCATTGGAATTTCCACCTGAAATCAAGGGGATGTAGACGGGTGGACGGGGGAATTACCAA
ORB     AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif GGBGDHBGGGGGDAT

StartP-valueSite
9277.10e-09GATGTAGACGGGTGGACGGGGGAATTACCAA
5165.01e-08TTGAAACAAAGGGGTTGGGGGGTATTGTATTTGAT
451.23e-07GTCCCGAAGTGGCGTATGGCGGTATCACGTTGTTG
5853.60e-07TGATGATCCCGCTGACCGGGTGGATGGATACATCA

Motif CHCCCACSCC

StartP-valueSite
2771.92e-07TGCCGTGTGCCCCCCACCCCTCTGTTTCAG
4774.47e-07TATAATCGAACACCCACCCCCTTGTGATTA
71.47e-06CCTGTCCTCCCACGCCTCTTGAGTGG

Motif AGAATMTGNCA

StartP-valueSite
6321.55e-06GAGTATCTTAAGAATCTGTCAGACCAAACTT
1021.92e-06ACATCAACATAGAATATGACATCCAAGAATT
1432.64e-06AATTATATCTAGCATCTGGCATCTTAGGTCT
5504.59e-06TACAGCGAACAGAAAATGCCACTATCATTCC
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
aORI10010130 100.0 947 0 0 1 947 1 947 0.0 1749
aORI10010120 97.36 947 25 0 1 947 1 947 0.0 1611