RefSeq NC_018515.1
Accession number NC_018515.1
DoriC accession number ORI96010268
OriC length 360 nt
OriC AT content 0.691667
The location of oriC region 239..598 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGTGTWTAAST

StartP-valueSite
2896.50e-07TATCCACAAATGTGTATAAGTTTGTGTATAA
3012.91e-06TGTATAAGTTTGTGTATAACTTTTTTATTGT
1135.54e-06TTTGACCGTGTGTGGATAACTTGGATCCAAA
2406.91e-06AACAACAAATCGTGTTTAAGGTTATTCACAA
2681.16e-05CAACACGTAATTTGTTTAAGTTATCCACAAA

Motif RACGACAA

StartP-valueSite
2247.31e-06TACAATACCTGACGACAACAACAAATCG
1633.82e-05TAATTTTTCAAACGGCAAATATTCCTGT
44.64e-05TTTAACGACACCTCCTTTATT
408.13e-05AAAACATTTCGAAGACAATCAAACTTAC
251.49e-04CTTTATTTCAAACGAAAAACATTTCGAA

Motif GWCAAGSRARG

StartP-valueSite
3432.01e-08TTCATTTTTAGACAAGGGAGGTCCGTCA
899.57e-07AATTTAATCTGTCAAGCAAAGGACTTTGACC
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI96010268 100.0 360 0 0 1 360 1 360 0.0 665
ORI95010942 88.981 363 31 8 1 359 1 358 0.0 440
ORI96010239 78.947 342 49 20 26 356 34 363 0.0 211
ORI92710474 88.172 93 8 3 265 356 260 350 1.18e-24 108
ORI10010187 88.172 93 8 3 265 356 260 350 1.18e-24 108