RefSeq NC_011830.1
Accession number NC_011830.1
DoriC accession number ORI92710474
OriC length 355 nt
OriC AT content 0.676056
The location of oriC region 5278872..92 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TGTGDATAACT

StartP-valueSite
1072.80e-07ACAATTAGATTGTGGATAACTTAAGCTCCGG
2961.32e-06TGTATAAGTTTGTGTATAACTTTTTTATTGT
2843.47e-06TATCCACAAATGTGTATAAGTTTGTGTATAA
1737.08e-06ACTAACTTCCTGTTGATAACCCCCAAAAAAA
1421.06e-05GTTATCCACCTGTGAATAAATTTATATTAGG

Motif TRCACMKC

StartP-valueSite
2091.91e-05ATTATGATTTTACACCGCCTTTAATTTC
91.91e-05ACTGCTATTGCACCTCCTTCAAGGGA
2504.05e-05TTATCATTTGTACACAGCAATAATTTTA
434.05e-05AAATAAAAATTGCACATCTCTAGAGATT

Motif AAGGGA

StartP-valueSite
3401.06e-04TAATTAGACAAAGGGAGGTCCACTGA
211.06e-04CACCTCCTTCAAGGGAAAAAACAAAT
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI92710474 100.0 355 0 0 1 355 1 355 0.0 656
ORI10010187 99.718 355 1 0 1 355 1 355 0.0 651
ORI96010231 90.137 365 26 2 1 355 1 365 0.0 466
ORI96010239 77.377 305 53 16 56 351 67 364 1.90016e-42 167
ORI95010942 75.081 309 60 15 50 350 56 355 8.95e-31 128
ORI96010268 88.172 93 8 3 260 350 265 356 1.17e-24 108