RefSeq NC_003091
DoriC accession number pORI00000142
OriC length 1303 nt
OriC AT content 0.7206
The location of oriC region 1180..2482 nt
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OriC map
OriC sequences
AATTTAAAATTTAAAAATATAATAGTAAAAATTTTTAAAAAATAATTGACTGCCAGGAAAATTATTTGTATTCTACCATTTTTTAAATAGTTGAATAGTCCATTTTTACTATAAAACATAACATATATGTTATGCCTGCTTTGACTTAATATACCATATTTTTTAAAAGATGTAAAGGATTTATTTACTAAAGTAAAAAAATGAGTTGTGAAGCAGGTTGCAAAAAAAATAAAAGCGATCTGCTTTTTTATATAAAAAAAACTTACTATTATATTTGTAACAAATTTTATACATAAGATAAATTCGTATGTATAGCCGTTCTGCTCGAAACGGTATAGCACCGTAATGGTGGTATTATGAATTGTAGCAAGGTGCGAGGCTACCTTTAAAAGTCTTGGAGGTGCTCTGAGTGGGTACTTTATTAGGGTTATAATTTAGAAAGTAAGCTAAAACTCTAGGTGTTGGGCAGGGCTAACACTGGCATATAATTAAATATGCGATAAAGTAAGTTAAACGATGCGAACATAGCGATATACGACCATTGTATCATTATCAATCGTTTTTTCCCCTTTTTACAAGGGGGAAAGTCTGCACTCAGCTCAATGAGCTCAACCGACCATAATATCATTGTTTTAATCAATTGTCAATATGTTTTTTAACATAGATATATAAAAAAATTGGAGGTACAATAAAATGAAAACAATAAGATTTGAAGAATTAAATAAGGCAATTACAAGAAAAAGGGGGAATGTGGAAGACAAAACTAATTTGATGACACAGTTACAAGAGTATGTTAAAGAAGAAAAGGAAGACATAGAATACTTGGAAAAATTAAGAAATGTTTACAAAAATTGTGTGAAGTTTGGAAATACTGGAAAAGATGTAGAAGTTGCAGATGTAGAATTTGAAGCATTTGAAAAGTTTAAAAAAGAATATCTAGAAAAATTTTATAAATAAAGGAGAGTATAAAAAATGAAGATAACAGAATTAAAGTTTGAACTTGGACAATTTGGGAAAAGAATGAATTTAGTAGGAGTTGAACCTTACTACACTTATGAAGCTGGAAAAAAAACTGATAAAATAGGTGGTTACAAGTATACTACAGTTTTGATGGATAGAGATTATGAGAAAATTGACATAAAAATTGAAGGTAATAGATTAATTGAAGAACAGGAAAAATACGATATACCTGTAAAATTCAATGGTTTAGAAGTAAGTTTTTATCAAGATTTTACAACTAAAAATCTATATTTAAAGGCAACAGCTAAAAATCTTGAAATATTGAAATAATAGGGGGTTGAGA
AATTTAAAATTTAAAAATATAATAGTAAAAATTTTTAAAAAATAATTGACTGCCAGGAAAATTATTTGTATTCTACCATTTTTTAAATAGTTGAATAGTCCATTTTTACTATAAAACATAACATATATGTTATGCCTGCTTTGACTTAATATACCATATTTTTTAAAAGATGTAAAGGATTTATTTACTAAAGTAAAAAAATGAGTTGTGAAGCAGGTTGCAAAAAAAATAAAAGCGATCTGCTTTTTTATATAAAAAAAACTTACTATTATATTTGTAACAAATTTTATACATAAGATAAATTCGTATGTATAGCCGTTCTGCTCGAAACGGTATAGCACCGTAATGGTGGTATTATGAATTGTAGCAAGGTGCGAGGCTACCTTTAAAAGTCTTGGAGGTGCTCTGAGTGGGTACTTTATTAGGGTTATAATTTAGAAAGTAAGCTAAAACTCTAGGTGTTGGGCAGGGCTAACACTGGCATATAATTAAATATGCGATAAAGTAAGTTAAACGATGCGAACATAGCGATATACGACCATTGTATCATTATCAATCGTTTTTTCCCCTTTTTACAAGGGGGAAAGTCTGCACTCAGCTCAATGAGCTCAACCGACCATAATATCATTGTTTTAATCAATTGTCAATATGTTTTTTAACATAGATATATAAAAAAATTGGAGGTACAATAAAATGAAAACAATAAGATTTGAAGAATTAAATAAGGCAATTACAAGAAAAAGGGGGAATGTGGAAGACAAAACTAATTTGATGACACAGTTACAAGAGTATGTTAAAGAAGAAAAGGAAGACATAGAATACTTGGAAAAATTAAGAAATGTTTACAAAAATTGTGTGAAGTTTGGAAATACTGGAAAAGATGTAGAAGTTGCAGATGTAGAATTTGAAGCATTTGAAAAGTTTAAAAAAGAATATCTAGAAAAATTTTATAAATAAAGGAGAGTATAAAAAATGAAGATAACAGAATTAAAGTTTGAACTTGGACAATTTGGGAAAAGAATGAATTTAGTAGGAGTTGAACCTTACTACACTTATGAAGCTGGAAAAAAAACTGATAAAATAGGTGGTTACAAGTATACTACAGTTTTGATGGATAGAGATTATGAGAAAATTGACATAAAAATTGAAGGTAATAGATTAATTGAAGAACAGGAAAAATACGATATACCTGTAAAATTCAATGGTTTAGAAGTAAGTTTTTATCAAGATTTTACAACTAAAAATCTATATTTAAAGGCAACAGCTAAAAATCTTGAAATATTGAAATAATAGGGGGTTGAGA
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif CRHTSHGMWCAWWRMGVTAWASSAMC

StartP-valueSite
3171.30e-14TATGTATAGCCGTTCTGCTCGAAACGGTATAGCACCGTAATGGTGG
5921.64e-13GGAAAGTCTGCACTCAGCTCAATGAGCTCAACCGACCATAATATCA
5155.87e-13GTAAGTTAAACGATGCGAACATAGCGATATACGACCATTGTATCAT

Motif GKGCRRGGCTAMC

StartP-valueSite
3721.18e-09TTGTAGCAAGGTGCGAGGCTACCTTTAAAAGTC
4644.69e-09TCTAGGTGTTGGGCAGGGCTAACACTGGCATAT

Motif GTWTWCTMCMNTTTT

StartP-valueSite
5591.85e-08ATTATCAATCGTTTTTTCCCCTTTTTACAAGGGGG
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10956.99e-08GTGGTTACAAGTATACTACAGTTTTGATGGATAGA
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939.11e-07TTAAATAGTTGAATAGTCCATTTTTACTATAAAAC
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
pORI00000142 100.0 1303 0 0 1 1303 1 1303 0.0 2407