RefSeq NC_001425
DoriC accession number pORI00000352
OriC length 1752 nt
OriC AT content 0.2945
The location of oriC region 9420..125 nt
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OriC map
OriC sequences
TATCGATCCGCACTAACTCGCTGCCCGCCCCTACTCCCGCGCCGACCTCTCCGTGACCCGCACGGAGAGGTGTCGGCGGCGGTCGGAGGCTTGCCCACGAGGCGCGACCTGCGAGGCAGCCGCAGGCTTGCCCACGGGGCCTCCCACCCTCGGTCCCACCCTCGGTCCCACCTTCGGTCCCACGGTGGACGCGACGGTGGGAGCAACGGCCGAGCCCCCTGCTGAAGCAACCCCGCCCGGCGGGCGTCACTGATATCAGTGACCCACAACTCGCTCTGCCTGTGGTTACTGCCTCCGAGGCACCGCCATCGGGTCCGCCAGCCCACCGCCATACGCCCGCCCACGACCGCCATCCGACCGGAATGCATGGCGGTCCCATGGCGGTCGGATCGGACCCCATGGCGGACCCTTGGCGGTGCCATGGCGGACCCAGCGGAGCGAGCAAGTTATCGCGAGAGCAATGCTCTCGCGGGCGCTCGTTGGGGCGAGCAAGTTATCCGCTTGGAGACTCCAGCGGTGCCCCGACCGAGGGCGGTCGGGGTTCCCCGGGGAGGGGAACCCCCTTTGTCCTCACCCCGGTTTTGATCACGTCGGCCTACGCCGACGGACCCGCGCGGCGCGAGCCGTGCGGAACGGAAAACCCGGCTGCCGATCCCCTCGCCCGCCGCCCGCGTTCCCGCCCCACCTCCCTCTCCTCCTGGTGCTCGTGGCGGTCGTGGGTGGCGTAGAGGGGATGTCTGCCCAAGCGGAAGCCCCCGACCATGCGCGGTGACGTGGGACGCCGCGAAGCCCGGAACCGGATCCCCGCAACACCCAGCGCAACCCATGGCGCAACCCATGGCGCAACACCCAGCGCAACCCCGACCAAGGACGGCCGGGAACCCGCTACGACACCCCCTCGACGGGCAGCGCGTCGACTCCCGGTCCGAGCGTCCGCCGGCCTTTCCGGGCGGCCACGTCCTGGTGCTCGATGTCCCCCAGGAGTGCGTCCGGCTCCACTCGCTCGACGGGCAGCAGCCGCGGACTCGCGTCCGCCGTCGGCGTGCTCCTGGTGGTGCTCGGGCCGGTGCCGAGGTGACGGCGCGGGGTGCTCATGACGGGAGTCTCCCGTGCCGTTCCCGGAGCTCCCGCAGCGGCCCTGATCGAGCCGTGCGGCTTGTGCGTTCGTGAATGCAAGAGGTGTGACCGTTCTTCGCGTGCACGCGTGTGCTCGTGCACCTGTGCACGCGGTACGGCTTCGCCGCCGACTTCGTCGTGACCGGAGCGGTCACACCTCAGGCATTACGAATGACCTCGGCTGGTCGCGCCCTGCGTTGTGCCCTGGGTCGCGTCCTGGATTCCGGCCTGAGTCACGTCCTGGGTCGCACCGGACGGGTCCCCGGCCGCGCCCGGTTCGGCGCCGTGACCTGGTGGACAAGGGGGCGGTCGGCTGCCGTTCCGCGCGCCGACTTCTTGCTGGGAGCGGTGTCGGCGGGCGCCTTCGGATCGGAATGCAAGGGTGTGCGGCTTGCTGCTGCCGTACGTCATCTCGAAGACGTACGCGGGCCGTCGGTGACGTACTCGAGGAACGAGGCCGGGCTCGGCTCGGCTTGGTCGACCCCAGGGGCTTTTTCGTCTGCGGTCCTGTCTGCAGGCCGGTGACTCCAGAGAAGGGTTGAAGCGGAGTTGCGGGGCTAGCCCCCCGAGCCTCCATCGTTCCGACCGCCCGGCCTGTCCGGGACGGGAGGACTTTTCGAGCACCTGGAGGAGCAC
TATCGATCCGCACTAACTCGCTGCCCGCCCCTACTCCCGCGCCGACCTCTCCGTGACCCGCACGGAGAGGTGTCGGCGGCGGTCGGAGGCTTGCCCACGAGGCGCGACCTGCGAGGCAGCCGCAGGCTTGCCCACGGGGCCTCCCACCCTCGGTCCCACCCTCGGTCCCACCTTCGGTCCCACGGTGGACGCGACGGTGGGAGCAACGGCCGAGCCCCCTGCTGAAGCAACCCCGCCCGGCGGGCGTCACTGATATCAGTGACCCACAACTCGCTCTGCCTGTGGTTACTGCCTCCGAGGCACCGCCATCGGGTCCGCCAGCCCACCGCCATACGCCCGCCCACGACCGCCATCCGACCGGAATGCATGGCGGTCCCATGGCGGTCGGATCGGACCCCATGGCGGACCCTTGGCGGTGCCATGGCGGACCCAGCGGAGCGAGCAAGTTATCGCGAGAGCAATGCTCTCGCGGGCGCTCGTTGGGGCGAGCAAGTTATCCGCTTGGAGACTCCAGCGGTGCCCCGACCGAGGGCGGTCGGGGTTCCCCGGGGAGGGGAACCCCCTTTGTCCTCACCCCGGTTTTGATCACGTCGGCCTACGCCGACGGACCCGCGCGGCGCGAGCCGTGCGGAACGGAAAACCCGGCTGCCGATCCCCTCGCCCGCCGCCCGCGTTCCCGCCCCACCTCCCTCTCCTCCTGGTGCTCGTGGCGGTCGTGGGTGGCGTAGAGGGGATGTCTGCCCAAGCGGAAGCCCCCGACCATGCGCGGTGACGTGGGACGCCGCGAAGCCCGGAACCGGATCCCCGCAACACCCAGCGCAACCCATGGCGCAACCCATGGCGCAACACCCAGCGCAACCCCGACCAAGGACGGCCGGGAACCCGCTACGACACCCCCTCGACGGGCAGCGCGTCGACTCCCGGTCCGAGCGTCCGCCGGCCTTTCCGGGCGGCCACGTCCTGGTGCTCGATGTCCCCCAGGAGTGCGTCCGGCTCCACTCGCTCGACGGGCAGCAGCCGCGGACTCGCGTCCGCCGTCGGCGTGCTCCTGGTGGTGCTCGGGCCGGTGCCGAGGTGACGGCGCGGGGTGCTCATGACGGGAGTCTCCCGTGCCGTTCCCGGAGCTCCCGCAGCGGCCCTGATCGAGCCGTGCGGCTTGTGCGTTCGTGAATGCAAGAGGTGTGACCGTTCTTCGCGTGCACGCGTGTGCTCGTGCACCTGTGCACGCGGTACGGCTTCGCCGCCGACTTCGTCGTGACCGGAGCGGTCACACCTCAGGCATTACGAATGACCTCGGCTGGTCGCGCCCTGCGTTGTGCCCTGGGTCGCGTCCTGGATTCCGGCCTGAGTCACGTCCTGGGTCGCACCGGACGGGTCCCCGGCCGCGCCCGGTTCGGCGCCGTGACCTGGTGGACAAGGGGGCGGTCGGCTGCCGTTCCGCGCGCCGACTTCTTGCTGGGAGCGGTGTCGGCGGGCGCCTTCGGATCGGAATGCAAGGGTGTGCGGCTTGCTGCTGCCGTACGTCATCTCGAAGACGTACGCGGGCCGTCGGTGACGTACTCGAGGAACGAGGCCGGGCTCGGCTCGGCTTGGTCGACCCCAGGGGCTTTTTCGTCTGCGGTCCTGTCTGCAGGCCGGTGACTCCAGAGAAGGGTTGAAGCGGAGTTGCGGGGCTAGCCCCCCGAGCCTCCATCGTTCCGACCGCCCGGCCTGTCCGGGACGGGAGGACTTTTCGAGCACCTGGAGGAGCAC
AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif WKCSGWCCKGAATGCAAG

StartP-valueSite
14801.34e-10GGCGGGCGCCTTCGGATCGGAATGCAAGGGTGTGCGGC
11601.29e-09GTGCGGCTTGTGCGTTCGTGAATGCAAGAGGTGTGACC
3522.08e-09CACGACCGCCATCCGACCGGAATGCATGGCGGTCCCAT
16176.93e-08CTTTTTCGTCTGCGGTCCTGTCTGCAGGCCGGTGACTC
6227.70e-08GCGCGGCGCGAGCCGTGCGGAACGGAAAACCCGGCTGC

Motif AGCAAGTTAT

StartP-valueSite
4885.66e-08CGTTGGGGCGAGCAAGTTATCCGCTTGGAG
4415.66e-08CAGCGGAGCGAGCAAGTTATCGCGAGAGCA

Motif CCTSGTSGTGMTSGGRGCGGT

StartP-valueSite
12488.62e-10TCGCCGCCGACTTCGTCGTGACCGGAGCGGTCACACCTCAG
10481.38e-09TCGGCGTGCTCCTGGTGGTGCTCGGGCCGGTGCCGAGGTGA
6941.38e-09ACCTCCCTCTCCTCCTGGTGCTCGTGGCGGTCGTGGGTGGC
14468.16e-09TTCCGCGCGCCGACTTCTTGCTGGGAGCGGTGTCGGCGGGC
14069.95e-09GGCGCCGTGACCTGGTGGACAAGGGGGCGGTCGGCTGCCGT
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
pORI00000352 100.0 1752 0 0 1 1752 1 1752 0.0 3236