RefSeq NC_017187.1
Accession number NC_017187.1
DoriC accession number ORI96040562
OriC length 229 nt
OriC AT content 0.825328
The location of oriC region 2256447..2256675 nt
Browse in NCBI
OriC map
OriC sequences
-CTTTTCACTCTTTATTCATAATTTTTATTCACATAATTTAAAATTCGATTATATCGTATTTGTATAAAAATATTTTATCTAAAAGAAAAAAATTATTCACAACTTATTCACTACGTGTACAACTCTTATATTTAGCTAAATTTTGTTATTTATATCTTATTGAAGTTCTTTTATAAAAAATTTCGATATAATATCTACAATTACGATTAAATAAAGAGTTTATAAATAAdnaA
-CTTTTCACTCTTTATTCATAATTTTTATTCACATAATTTAAAATTCGATTATATCGTATTTGTATAAAAATATTTTATCTAAAAGAAAAAAATTATTCACAACTTATTCACTACGTGTACAACTCTTATATTTAGCTAAATTTTGTTATTTATATCTTATTGAAGTTCTTTTATAAAAAATTTCGATATAATATCTACAATTACGATTAAATAAAGAGTTTATAAATAAdnaA
-CTTTTCACTCTTTATTCATAATTTTTATTCACATAATTTAAAATTCGATTATATCGTATTTGTATAAAAATATTTTATCTAAAAGAAAAAAATTATTCACAACTTATTCACTACGTGTACAACTCTTATATTTAGCTAAATTTTGTTATTTATATCTTATTGAAGTTCTTTTATAAAAAATTTCGATATAATATCTACAATTACGATTAAATAAAGAGTTTATAAATAAdnaA
-CTTTTCACTCTTTATTCATAATTTTTATTCACATAATTTAAAATTCGATTATATCGTATTTGTATAAAAATATTTTATCTAAAAGAAAAAAATTATTCACAACTTATTCACTACGTGTACAACTCTTATATTTAGCTAAATTTTGTTATTTATATCTTATTGAAGTTCTTTTATAAAAAATTTCGATATAATATCTACAATTACGATTAAATAAAGAGTTTATAAATAAdnaA
-CTTTTCACTCTTTATTCATAATTTTTATTCACATAATTTAAAATTCGATTATATCGTATTTGTATAAAAATATTTTATCTAAAAGAAAAAAATTATTCACAACTTATTCACTACGTGTACAACTCTTATATTTAGCTAAATTTTGTTATTTATATCTTATTGAAGTTCTTTTATAAAAAATTTCGATATAATATCTACAATTACGATTAAATAAAGAGTTTATAAATAAdnaA
-CTTTTCACTCTTTATTCATAATTTTTATTCACATAATTTAAAATTCGATTATATCGTATTTGTATAAAAATATTTTATCTAAAAGAAAAAAATTATTCACAACTTATTCACTACGTGTACAACTCTTATATTTAGCTAAATTTTGTTATTTATATCTTATTGAAGTTCTTTTATAAAAAATTTCGATATAATATCTACAATTACGATTAAATAAAGAGTTTATAAATAAdnaA
-CTTTTCACTCTTTATTCATAATTTTTATTCACATAATTTAAAATTCGATTATATCGTATTTGTATAAAAATATTTTATCTAAAAGAAAAAAATTATTCACAACTTATTCACTACGTGTACAACTCTTATATTTAGCTAAATTTTGTTATTTATATCTTATTGAAGTTCTTTTATAAAAAATTTCGATATAATATCTACAATTACGATTAAATAAAGAGTTTATAAATAAdnaA
-CTTTTCACTCTTTATTCATAATTTTTATTCACATAATTTAAAATTCGATTATATCGTATTTGTATAAAAATATTTTATCTAAAAGAAAAAAATTATTCACAACTTATTCACTACGTGTACAACTCTTATATTTAGCTAAATTTTGTTATTTATATCTTATTGAAGTTCTTTTATAAAAAATTTCGATATAATATCTACAATTACGATTAAATAAAGAGTTTATAAATAAdnaa
-CTTTTCACTCTTTATTCATAATTTTTATTCACATAATTTAAAATTCGATTATATCGTATTTGTATAAAAATATTTTATCTAAAAGAAAAAAATTATTCACAACTTATTCACTACGTGTACAACTCTTATATTTAGCTAAATTTTGTTATTTATATCTTATTGAAGTTCTTTTATAAAAAATTTCGATATAATATCTACAATTACGATTAAATAAAGAGTTTATAAATAAdnaA
-CTTTTCACTCTTTATTCATAATTTTTATTCACATAATTTAAAATTCGATTATATCGTATTTGTATAAAAATATTTTATCTAAAAGAAAAAAATTATTCACAACTTATTCACTACGTGTACAACTCTTATATTTAGCTAAATTTTGTTATTTATATCTTATTGAAGTTCTTTTATAAAAAATTTCGATATAATATCTACAATTACGATTAAATAAAGAGTTTATAAATAAdnaA
-CTTTTCACTCTTTATTCATAATTTTTATTCACATAATTTAAAATTCGATTATATCGTATTTGTATAAAAATATTTTATCTAAAAGAAAAAAATTATTCACAACTTATTCACTACGTGTACAACTCTTATATTTAGCTAAATTTTGTTATTTATATCTTATTGAAGTTCTTTTATAAAAAATTTCGATATAATATCTACAATTACGATTAAATAAAGAGTTTATAAATAAdnaA
5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif CTACRWKTACR

StartP-valueSite
1111.54e-07AACTTATTCACTACGTGTACAACTCTTATAT
1958.93e-07GATATAATATCTACAATTACGATTAAATAAA

Motif AAAGAR

StartP-valueSite
2139.21e-05ACGATTAAATAAAGAGTTTATAAATA
826.44e-04ATTTTATCTAAAAGAAAAAAATTATT

Motif TTCGAT

StartP-valueSite
1822.34e-04TATAAAAAATTTCGATATAATATCTA
442.34e-04TAATTTAAAATTCGATTATATCGTAT
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI96040562 100.0 229 0 0 1 229 1 229 0.0 424
ORI92240124 100.0 229 0 0 1 229 1 229 0.0 424