RefSeq NC_017179.1
Accession number NC_017179.1
DoriC accession number ORI96010016
OriC length 241 nt
OriC AT content 0.784232
The location of oriC region 1321..1561 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif AGSMRG

StartP-valueSite
2279.39e-06AAAAAGCCAGAGGAGGTTATCCACA
2214.45e-05ATATATAAAAAGCCAGAGGAGGTTAT

Motif TATMCACA

StartP-valueSite
2342.85e-05CAGAGGAGGTTATCCACA
1101.04e-04ATTAACATCTTATACACATGTTAATATC
31.04e-04TTTATACACAATTGTATGTT
1631.79e-04TTATTAACATTATCAACAACACCTACTA

Motif ACWAWG

StartP-valueSite
1899.90e-04TACTATTACTACTATGATTTTAACTT
929.90e-04GTCTAAAATAACAAAGATATTAACAT
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI96010016 100.0 241 0 0 1 241 1 241 0.0 446