RefSeq NC_015581.1
Accession number NC_015581.1
DoriC accession number ORI94010863
OriC length 259 nt
OriC AT content 0.698842
The location of oriC region 1932282..85 nt
Browse in NCBI
OriC map
OriC sequences
-GTTGGAATAGGTCAACTATTTAAGGTTATAAGGATTTGAGATAGAGGCGATTAAAATTATTTAATAAAAATTTTATACACGGTTATTTGTTATATATTTCAATAATTTGCGAGTTTTTTAAAAAACTTATCCACAGGGTTTGCGATAGACTTATCCACAGGTTAAGGCTGTTTTTTAAAGTTATTCACAGTTACAATTAAATCCATAGCGCAATTATCCCCTAAATCGGTCAATGAACACAATAAAAGGAGCCGATGATdnaA
-GTTGGAATAGGTCAACTATTTAAGGTTATAAGGATTTGAGATAGAGGCGATTAAAATTATTTAATAAAAATTTTATACACGGTTATTTGTTATATATTTCAATAATTTGCGAGTTTTTTAAAAAACTTATCCACAGGGTTTGCGATAGACTTATCCACAGGTTAAGGCTGTTTTTTAAAGTTATTCACAGTTACAATTAAATCCATAGCGCAATTATCCCCTAAATCGGTCAATGAACACAATAAAAGGAGCCGATGATdnaA
-GTTGGAATAGGTCAACTATTTAAGGTTATAAGGATTTGAGATAGAGGCGATTAAAATTATTTAATAAAAATTTTATACACGGTTATTTGTTATATATTTCAATAATTTGCGAGTTTTTTAAAAAACTTATCCACAGGGTTTGCGATAGACTTATCCACAGGTTAAGGCTGTTTTTTAAAGTTATTCACAGTTACAATTAAATCCATAGCGCAATTATCCCCTAAATCGGTCAATGAACACAATAAAAGGAGCCGATGATdnaA
-GTTGGAATAGGTCAACTATTTAAGGTTATAAGGATTTGAGATAGAGGCGATTAAAATTATTTAATAAAAATTTTATACACGGTTATTTGTTATATATTTCAATAATTTGCGAGTTTTTTAAAAAACTTATCCACAGGGTTTGCGATAGACTTATCCACAGGTTAAGGCTGTTTTTTAAAGTTATTCACAGTTACAATTAAATCCATAGCGCAATTATCCCCTAAATCGGTCAATGAACACAATAAAAGGAGCCGATGATdnaA
-GTTGGAATAGGTCAACTATTTAAGGTTATAAGGATTTGAGATAGAGGCGATTAAAATTATTTAATAAAAATTTTATACACGGTTATTTGTTATATATTTCAATAATTTGCGAGTTTTTTAAAAAACTTATCCACAGGGTTTGCGATAGACTTATCCACAGGTTAAGGCTGTTTTTTAAAGTTATTCACAGTTACAATTAAATCCATAGCGCAATTATCCCCTAAATCGGTCAATGAACACAATAAAAGGAGCCGATGATdnaA
-GTTGGAATAGGTCAACTATTTAAGGTTATAAGGATTTGAGATAGAGGCGATTAAAATTATTTAATAAAAATTTTATACACGGTTATTTGTTATATATTTCAATAATTTGCGAGTTTTTTAAAAAACTTATCCACAGGGTTTGCGATAGACTTATCCACAGGTTAAGGCTGTTTTTTAAAGTTATTCACAGTTACAATTAAATCCATAGCGCAATTATCCCCTAAATCGGTCAATGAACACAATAAAAGGAGCCGATGATdnaA
-GTTGGAATAGGTCAACTATTTAAGGTTATAAGGATTTGAGATAGAGGCGATTAAAATTATTTAATAAAAATTTTATACACGGTTATTTGTTATATATTTCAATAATTTGCGAGTTTTTTAAAAAACTTATCCACAGGGTTTGCGATAGACTTATCCACAGGTTAAGGCTGTTTTTTAAAGTTATTCACAGTTACAATTAAATCCATAGCGCAATTATCCCCTAAATCGGTCAATGAACACAATAAAAGGAGCCGATGATdnaA
-GTTGGAATAGGTCAACTATTTAAGGTTATAAGGATTTGAGATAGAGGCGATTAAAATTATTTAATAAAAATTTTATACACGGTTATTTGTTATATATTTCAATAATTTGCGAGTTTTTTAAAAAACTTATCCACAGGGTTTGCGATAGACTTATCCACAGGTTAAGGCTGTTTTTTAAAGTTATTCACAGTTACAATTAAATCCATAGCGCAATTATCCCCTAAATCGGTCAATGAACACAATAAAAGGAGCCGATGATdnaa
-GTTGGAATAGGTCAACTATTTAAGGTTATAAGGATTTGAGATAGAGGCGATTAAAATTATTTAATAAAAATTTTATACACGGTTATTTGTTATATATTTCAATAATTTGCGAGTTTTTTAAAAAACTTATCCACAGGGTTTGCGATAGACTTATCCACAGGTTAAGGCTGTTTTTTAAAGTTATTCACAGTTACAATTAAATCCATAGCGCAATTATCCCCTAAATCGGTCAATGAACACAATAAAAGGAGCCGATGATdnaA
-GTTGGAATAGGTCAACTATTTAAGGTTATAAGGATTTGAGATAGAGGCGATTAAAATTATTTAATAAAAATTTTATACACGGTTATTTGTTATATATTTCAATAATTTGCGAGTTTTTTAAAAAACTTATCCACAGGGTTTGCGATAGACTTATCCACAGGTTAAGGCTGTTTTTTAAAGTTATTCACAGTTACAATTAAATCCATAGCGCAATTATCCCCTAAATCGGTCAATGAACACAATAAAAGGAGCCGATGATdnaA
-GTTGGAATAGGTCAACTATTTAAGGTTATAAGGATTTGAGATAGAGGCGATTAAAATTATTTAATAAAAATTTTATACACGGTTATTTGTTATATATTTCAATAATTTGCGAGTTTTTTAAAAAACTTATCCACAGGGTTTGCGATAGACTTATCCACAGGTTAAGGCTGTTTTTTAAAGTTATTCACAGTTACAATTAAATCCATAGCGCAATTATCCCCTAAATCGGTCAATGAACACAATAAAAGGAGCCGATGATdnaA
5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TTATHCACAGK

StartP-valueSite
1511.22e-07TGCGATAGACTTATCCACAGGTTAAGGCTGT
1271.22e-07TTTAAAAAACTTATCCACAGGGTTTGCGATA
1812.77e-06TTTTTTAAAGTTATTCACAGTTACAATTAAA
733.39e-06AATAAAAATTTTATACACGGTTATTTGTTAT

Motif GAGSCG

StartP-valueSite
2493.13e-05ACAATAAAAGGAGCCGATGAT
447.16e-05ATTTGAGATAGAGGCGATTAAAATTA

Motif TTTGCG

StartP-valueSite
1391.56e-04ATCCACAGGGTTTGCGATAGACTTAT
1061.56e-04ATTTCAATAATTTGCGAGTTTTTTAA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI94010863 100.0 259 0 0 1 259 1 259 0.0 479