RefSeq GCF_000215345.2
Accession number NC_021878.1
DoriC accession number ORI97010444
OriC length 229 nt
OriC AT content 0.820961
The location of oriC region 2253005..2253233 nt
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OriC map
OriC sequences
-CTTTTCACTCTTTATTCATAATTTTTATTCACATAATTTAGAATTCGATTATATCGTATTTGTATAAAAATATTTTATCTAAAAGAAAAAAATTATTCACAACTTATTCACTACGTGTACAACTCTTATATTTAGCTAAATTTTGTTATTTATATCTTATTGAAGTTCTTTTATAAAAAATTTCGATATAATATCTACAATTACGATTAAATAAAGAGTTTATAAATAAdnaA
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-CTTTTCACTCTTTATTCATAATTTTTATTCACATAATTTAGAATTCGATTATATCGTATTTGTATAAAAATATTTTATCTAAAAGAAAAAAATTATTCACAACTTATTCACTACGTGTACAACTCTTATATTTAGCTAAATTTTGTTATTTATATCTTATTGAAGTTCTTTTATAAAAAATTTCGATATAATATCTACAATTACGATTAAATAAAGAGTTTATAAATAAdnaA
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-CTTTTCACTCTTTATTCATAATTTTTATTCACATAATTTAGAATTCGATTATATCGTATTTGTATAAAAATATTTTATCTAAAAGAAAAAAATTATTCACAACTTATTCACTACGTGTACAACTCTTATATTTAGCTAAATTTTGTTATTTATATCTTATTGAAGTTCTTTTATAAAAAATTTCGATATAATATCTACAATTACGATTAAATAAAGAGTTTATAAATAAdnaA
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif TTATTCAC

StartP-valueSite
1046.90e-05TATTCACAACTTATTCACTACGTGTACA
936.90e-05AAGAAAAAAATTATTCACAACTTATTCA
256.90e-05TTCATAATTTTTATTCACATAATTTAGA
11.87e-04.CTTTTCACTCTTTATTCA
124.44e-04TTTTCACTCTTTATTCATAATTTTTATT

Motif CGWTTA

StartP-valueSite
1147.38e-05TTATTCACTACGTGTACAACTCTTAT
2042.92e-04TCTACAATTACGATTAAATAAAGAGT
462.92e-04ATTTAGAATTCGATTATATCGTATTT

Motif AAAGAR

StartP-valueSite
2131.01e-04ACGATTAAATAAAGAGTTTATAAATA
826.59e-04ATTTTATCTAAAAGAAAAAAATTATT
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI96040562 99.563 229 1 0 1 229 1 229 0.0 418
ORI92240124 99.563 229 1 0 1 229 1 229 0.0 418