RefSeq NZ_AP011952.1
DoriC accession number aORI10010270
OriC length 797 nt
OriC AT content 0.3802
The location of oriC region 1259870..1260666 nt
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OriC map
OriC sequences
GGGAGGTCCGGTTCAACTGTAAGGACTCCCTGTAACCATTTTTCATATGTGGGGGATGGTTTTCAACTGTAAAATCATTTGGGTTTCCTGTTTCTCTGGGTGTGGGTCAATGGTTTCAAGTGTAAAGTTTTTTCTCTCGTTTAGTTGCCCAGGTGAGAGAGGTCAATTTCAACTGTAACCAGCGAAACTTTATTCAGGATTGAGAGAGAGAGGTCAATTTCAACTGTAACTTTATTATTAAAAATTTGTTTAAAATAGTGACATCAGGTTCAACTGTAAAGGTTCTTTCCTAGTTCAGCCTGGTTTACAGAGCGAAAAACAAAAACCCCAAATACACTTGAAATGAATGTCTCAAAAAATCGAGATCAATTAATACTAAGTTACACTTGAAATGAATGTCTCCCTTACAGGTCACCAGAATCATGGCCAGATTACACTTGAAATGAATGTCTCACACATCTCCCACTGAATCAGAGAAATGGTTGAGGAACAGCAGGATTTTTACACTTGAAATTCATCTCTCATGAGTTCCCATCGAGGATGCAGATGGTTACACTTGAAATGGATGTCCCACATACGTTATTATAAATCAAGCTGGTTTTAATAAAAACTTTTATCTAATAGTTGGAATAAGAAAATTTACACTTGAAATCTACCACACTCCCACATCAGGGGATGGTAGTACGGGGCGCTGCCAGCTGAAAAGGTCATCCTGAATTTCACTGTATCCAGATTTTAGGGCCTTTATTGATAATTTGATGCAGCAGTTTTCTCTAAAAATTAGTTGAAGTGGTACC
GGGAGGTCCGGTTCAACTGTAAGGACTCCCTGTAACCATTTTTCATATGTGGGGGATGGTTTTCAACTGTAAAATCATTTGGGTTTCCTGTTTCTCTGGGTGTGGGTCAATGGTTTCAAGTGTAAAGTTTTTTCTCTCGTTTAGTTGCCCAGGTGAGAGAGGTCAATTTCAACTGTAACCAGCGAAACTTTATTCAGGATTGAGAGAGAGAGGTCAATTTCAACTGTAACTTTATTATTAAAAATTTGTTTAAAATAGTGACATCAGGTTCAACTGTAAAGGTTCTTTCCTAGTTCAGCCTGGTTTACAGAGCGAAAAACAAAAACCCCAAATACACTTGAAATGAATGTCTCAAAAAATCGAGATCAATTAATACTAAGTTACACTTGAAATGAATGTCTCCCTTACAGGTCACCAGAATCATGGCCAGATTACACTTGAAATGAATGTCTCACACATCTCCCACTGAATCAGAGAAATGGTTGAGGAACAGCAGGATTTTTACACTTGAAATTCATCTCTCATGAGTTCCCATCGAGGATGCAGATGGTTACACTTGAAATGGATGTCCCACATACGTTATTATAAATCAAGCTGGTTTTAATAAAAACTTTTATCTAATAGTTGGAATAAGAAAATTTACACTTGAAATCTACCACACTCCCACATCAGGGGATGGTAGTACGGGGCGCTGCCAGCTGAAAAGGTCATCCTGAATTTCACTGTATCCAGATTTTAGGGCCTTTATTGATAATTTGATGCAGCAGTTTTCTCTAAAAATTAGTTGAAGTGGTACC
GGGAGGTCCGGTTCAACTGTAAGGACTCCCTGTAACCATTTTTCATATGTGGGGGATGGTTTTCAACTGTAAAATCATTTGGGTTTCCTGTTTCTCTGGGTGTGGGTCAATGGTTTCAAGTGTAAAGTTTTTTCTCTCGTTTAGTTGCCCAGGTGAGAGAGGTCAATTTCAACTGTAACCAGCGAAACTTTATTCAGGATTGAGAGAGAGAGGTCAATTTCAACTGTAACTTTATTATTAAAAATTTGTTTAAAATAGTGACATCAGGTTCAACTGTAAAGGTTCTTTCCTAGTTCAGCCTGGTTTACAGAGCGAAAAACAAAAACCCCAAATACACTTGAAATGAATGTCTCAAAAAATCGAGATCAATTAATACTAAGTTACACTTGAAATGAATGTCTCCCTTACAGGTCACCAGAATCATGGCCAGATTACACTTGAAATGAATGTCTCACACATCTCCCACTGAATCAGAGAAATGGTTGAGGAACAGCAGGATTTTTACACTTGAAATTCATCTCTCATGAGTTCCCATCGAGGATGCAGATGGTTACACTTGAAATGGATGTCCCACATACGTTATTATAAATCAAGCTGGTTTTAATAAAAACTTTTATCTAATAGTTGGAATAAGAAAATTTACACTTGAAATCTACCACACTCCCACATCAGGGGATGGTAGTACGGGGCGCTGCCAGCTGAAAAGGTCATCCTGAATTTCACTGTATCCAGATTTTAGGGCCTTTATTGATAATTTGATGCAGCAGTTTTCTCTAAAAATTAGTTGAAGTGGTACC
ORB     AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif TACACTTGAAATGAATGTCTCA

StartP-valueSite
4331.96e-13ATGGCCAGATTACACTTGAAATGAATGTCTCACACATCTCCC
3331.96e-13AAACCCCAAATACACTTGAAATGAATGTCTCAAAAAATCGAG
3826.67e-13AATACTAAGTTACACTTGAAATGAATGTCTCCCTTACAGGTC
5521.13e-12TGCAGATGGTTACACTTGAAATGGATGTCCCACATACGTTAT
5034.11e-12GCAGGATTTTTACACTTGAAATTCATCTCTCATGAGTTCCCA

Motif GDGAGRTCADKTTCAACTGTAA

StartP-valueSite
14.50e-13.GGGAGGTCCGGTTCAACTGTAAGGACTCCCTG
2088.89e-13GATTGAGAGAGAGAGGTCAATTTCAACTGTAACTTTATTATT
1578.89e-13GCCCAGGTGAGAGAGGTCAATTTCAACTGTAACCAGCGAAAC
2582.19e-11GTTTAAAATAGTGACATCAGGTTCAACTGTAAAGGTTCTTTC
515.12e-11TTTCATATGTGGGGGATGGTTTTCAACTGTAAAATCATTTGG

Motif CTMCCAC

StartP-valueSite
6611.86e-05ATCTACCACACTCCCACATCAGGGGAT
4601.86e-05TCTCACACATCTCCCACTGAATCAGAG
6535.03e-05CACTTGAAATCTACCACACTCCCACAT
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
aORI10010270 100.0 797 0 0 1 797 1 797 0.0 1472
aORI10010005 91.52 342 19 5 463 796 7 346 0.0 462