DoriC

RefSeq

NC_009635.1

DoriC accession number

aORI10010047

OriC length

854 nt

OriC AT content

0.8115

The location of oriC region

1203435..1204288 nt

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OriC map

OriC sequences

ATTTTCACCTTTATATTTAATTATATGCGTCGTATGATTTGTATTATGGTATATCTCAATCATATGGTATTTTTAAATATATTTTAAGTTTTGATTCATTTTACGATTTTTCTAAGCTAATTTATTATAATATCTCTGATAGTATATAATGTTTATCATTATTATTTATTATCATATATTTGTTATATGCTGTTTTTTTATTATTTTGGAGATAAATATGTGTTATTATTGTTATATATTTGTTATATATTTGTTATATATAATATTATAAAGTGATTCATAGTCTATATTATTTTATTTAATGAATTCACGGGTTATATTTTAGTATATATACTAAAAAGTCAATTCAAAAAAACTTTATTGCCATAGTGATAGTTTATATACTTTTAAAATTTTATTAAAGTTTTTTTTATATCTTTTTTAAGCAATTCTAAGGGAGATAATTTATAAATTATAAATTGATTCACAAGATATTTATAATATTATCTTTGATTCACAATATTTTAAAAATGAACATAATTTTGATAATAATTATACATTTAAAAATTTATTTATTAATATAAATATATATACAACAATTACTTAGAAAAATTAATGGTTTTCGGGTTTTCTATCGTTTAGAAAATAATCAATTAGAAATACCGAAAACTATAAAAATAGGGGGTGTGTAAGATATTATACTTTATTATAGTCAATCGCAGAACACCCTGCATAAATATTCATTATTAAATAAGCAGTATCTGTCGTTTATTTGCAAAAATATTCAATAATATTCAATAATATTCAATAAATATTTTTTAGATGATTTGACCCTCTATGTCATATATTTCATGATTGACTATACTGGTGGTATT

ORB AT-rich region

The information of repeat sequences

Motif SACCCTS

Start	P-value		Site
809	2.63e-06	TAGATGATTT	GACCCTC	TATGTCATAT
704	2.63e-06	AATCGCAGAA	CACCCTG	CATAAATATT

Motif CGGGTK

Start	P-value		Site
661	1.00e-05	ATAAAAATAG	GGGGTG	TGTAAGATAT
603	2.98e-05	TAATGGTTTT	CGGGTT	TTCTATCGTT
311	2.98e-05	AATGAATTCA	CGGGTT	ATATTTTAGT
844	4.95e-05	ATTGACTATA	CTGGTG	GTATT

Motif TGATTCRYA

Start	P-value		Site
490	6.46e-06	ATATTATCTT	TGATTCACA	ATATTTTAAA
460	6.46e-06	AATTATAAAT	TGATTCACA	AGATATTTAT
26	1.40e-05	TTTAATTATA	TGCGTCGTA	TGATTTGTAT
692	2.43e-05	TTTATTATAG	TCAATCGCA	GAACACCCTG
274	5.32e-05	TATTATAAAG	TGATTCATA	GTCTATATTA

The result of BLAST

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subject_id	identity	aln_length	mismatches	gaps	q_start	q_end	s_start	s_end	e_value	bit_score
aORI10010047	100.0	854	0	0	1	854	1	854	0.0	1578