RefSeq NC_009464.1
DoriC accession number aORI10010044
OriC length 976 nt
OriC AT content 0.6291
The location of oriC region 1793451..1794426 nt
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OriC map
OriC sequences
AAGGTTGTCGAAAAGTCCCTTGCTGTCCTTATTACCTTCTTTAGCAGCATTATCAGATGCCACTATGCCGGCATCGGCAGATGCTTTTGTACTATCACCAGATAATTTACCAACATCAGAAGATGTTCTACCAGCATCAGCAGATGCTCCAGCATCTGTGGGGGTGTTAGTCTCGGCACCTCCAGGGGGAAGAGGTGGTGTGGTCTTGTCAGTCAACATAAGATATGCACCAGAACCAGGCGTTTCCAGAGGAAATGATAGTATTTGTCATGTATTAATAGTTGTGGTAGAGAGAACCCCTTTATTTCTTGTGGAAATTCGGACAATTTGAGATGTGTTTTTGATTTAACGATATTTAATGCCAAATAAAAATTTTTTCTTCTGCACTGTAAGTCCATAAAGTGTCCAGAGCCAGAATATCAAAAATCGTGCCGACGTAAGGCCATCATTTCCACTGGAACTTATTTTATGCCGGATACCCCCACCCCTTAATTTCTACTGGAACTGAAAATCCAAAGCCAAGCTTTAGATTTGTCAGATGAAAATACCTTGTTGTAGTGGTTTGCAGATCAAAGTATTTATAGATAACGATTTATAGCTTAATAGATTATTTTTATTTAATTAAGTTTAATCTAAAATAGAATGGATTTTCGCGGGAAAATTATCTTTTGAATATGGGATGATCCATAGTACTGAATAATGAAATAATCATTATTTTGACTTATTTTCCAATATTACATCAAATTTCAGACTATCTTGAGCCGAAAATCCCGATATACCGGCTCCATTGGAAATAAAGGGGTAGGTGTGTTACCGCTAGCGAGTGAGCTCTAAAAATTTTTATGGAATTTTTACGTAAGAACAATGTCTATCGCTATTATAGACATGCTACAGAATTACAGACGTGCTACAATTATAGTCGTGCCACAGAACATCTATAGAAATAAATATTATCCACCAGCCCAATGCTGTTATT
AAGGTTGTCGAAAAGTCCCTTGCTGTCCTTATTACCTTCTTTAGCAGCATTATCAGATGCCACTATGCCGGCATCGGCAGATGCTTTTGTACTATCACCAGATAATTTACCAACATCAGAAGATGTTCTACCAGCATCAGCAGATGCTCCAGCATCTGTGGGGGTGTTAGTCTCGGCACCTCCAGGGGGAAGAGGTGGTGTGGTCTTGTCAGTCAACATAAGATATGCACCAGAACCAGGCGTTTCCAGAGGAAATGATAGTATTTGTCATGTATTAATAGTTGTGGTAGAGAGAACCCCTTTATTTCTTGTGGAAATTCGGACAATTTGAGATGTGTTTTTGATTTAACGATATTTAATGCCAAATAAAAATTTTTTCTTCTGCACTGTAAGTCCATAAAGTGTCCAGAGCCAGAATATCAAAAATCGTGCCGACGTAAGGCCATCATTTCCACTGGAACTTATTTTATGCCGGATACCCCCACCCCTTAATTTCTACTGGAACTGAAAATCCAAAGCCAAGCTTTAGATTTGTCAGATGAAAATACCTTGTTGTAGTGGTTTGCAGATCAAAGTATTTATAGATAACGATTTATAGCTTAATAGATTATTTTTATTTAATTAAGTTTAATCTAAAATAGAATGGATTTTCGCGGGAAAATTATCTTTTGAATATGGGATGATCCATAGTACTGAATAATGAAATAATCATTATTTTGACTTATTTTCCAATATTACATCAAATTTCAGACTATCTTGAGCCGAAAATCCCGATATACCGGCTCCATTGGAAATAAAGGGGTAGGTGTGTTACCGCTAGCGAGTGAGCTCTAAAAATTTTTATGGAATTTTTACGTAAGAACAATGTCTATCGCTATTATAGACATGCTACAGAATTACAGACGTGCTACAATTATAGTCGTGCCACAGAACATCTATAGAAATAAATATTATCCACCAGCCCAATGCTGTTATT
AAGGTTGTCGAAAAGTCCCTTGCTGTCCTTATTACCTTCTTTAGCAGCATTATCAGATGCCACTATGCCGGCATCGGCAGATGCTTTTGTACTATCACCAGATAATTTACCAACATCAGAAGATGTTCTACCAGCATCAGCAGATGCTCCAGCATCTGTGGGGGTGTTAGTCTCGGCACCTCCAGGGGGAAGAGGTGGTGTGGTCTTGTCAGTCAACATAAGATATGCACCAGAACCAGGCGTTTCCAGAGGAAATGATAGTATTTGTCATGTATTAATAGTTGTGGTAGAGAGAACCCCTTTATTTCTTGTGGAAATTCGGACAATTTGAGATGTGTTTTTGATTTAACGATATTTAATGCCAAATAAAAATTTTTTCTTCTGCACTGTAAGTCCATAAAGTGTCCAGAGCCAGAATATCAAAAATCGTGCCGACGTAAGGCCATCATTTCCACTGGAACTTATTTTATGCCGGATACCCCCACCCCTTAATTTCTACTGGAACTGAAAATCCAAAGCCAAGCTTTAGATTTGTCAGATGAAAATACCTTGTTGTAGTGGTTTGCAGATCAAAGTATTTATAGATAACGATTTATAGCTTAATAGATTATTTTTATTTAATTAAGTTTAATCTAAAATAGAATGGATTTTCGCGGGAAAATTATCTTTTGAATATGGGATGATCCATAGTACTGAATAATGAAATAATCATTATTTTGACTTATTTTCCAATATTACATCAAATTTCAGACTATCTTGAGCCGAAAATCCCGATATACCGGCTCCATTGGAAATAAAGGGGTAGGTGTGTTACCGCTAGCGAGTGAGCTCTAAAAATTTTTATGGAATTTTTACGTAAGAACAATGTCTATCGCTATTATAGACATGCTACAGAATTACAGACGTGCTACAATTATAGTCGTGCCACAGAACATCTATAGAAATAAATATTATCCACCAGCCCAATGCTGTTATT
ORB     AT-rich region
The information of repeat sequences

Motif THTACCAGCATCAGCAGATGC

StartP-valueSite
1272.14e-13CAGAAGATGTTCTACCAGCATCAGCAGATGCTCCAGCATCT
649.04e-12CAGATGCCACTATGCCGGCATCGGCAGATGCTTTTGTACTA
405.18e-11TATTACCTTCTTTAGCAGCATTATCAGATGCCACTATGCCG
1067.67e-11CACCAGATAATTTACCAACATCAGAAGATGTTCTACCAGCA

Motif AVCCCDTHATTTCYASTGGAAMTKA

StartP-valueSite
4841.46e-13GGATACCCCCACCCCTTAATTTCTACTGGAACTGAAAATCCAAAG
4401.61e-12TGCCGACGTAAGGCCATCATTTCCACTGGAACTTATTTTATGCCG
2968.30e-12GGTAGAGAGAACCCCTTTATTTCTTGTGGAAATTCGGACAATTTG
2342.82e-11TATGCACCAGAACCAGGCGTTTCCAGAGGAAATGATAGTATTTGT

Motif ATAGDYGTGCTACAG

StartP-valueSite
9165.33e-09TGCTACAATTATAGTCGTGCCACAGAACATCTATA
8803.17e-08TATCGCTATTATAGACATGCTACAGAATTACAGAC
8998.49e-08CTACAGAATTACAGACGTGCTACAATTATAGTCGT
2781.64e-07TCATGTATTAATAGTTGTGGTAGAGAGAACCCCTT
8023.83e-07AAATAAAGGGGTAGGTGTGTTACCGCTAGCGAGTG
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
aORI10010044 100.0 976 0 0 1 976 1 976 0.0 1803