RefSeq | NC_008818.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | aORI10010036 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 634 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.5221 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 1225192..1225825 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
CTACCACCCCTATGCTTCGTCTGGAGAATGGGTATTCTTGCTCCGGGAATACCTAGCCAGAGCTAAACATAGCCTTTCACCATCAAGTTTATACAAACAGGCAAAAATACTCGGTGATGCATGGTATCTATACTCGCTGGCTAAGTAATACTGAGATGAGGCTCTGGGGTAGTGAAGATAAAAGGGGGGATGAAGCTTAGGTGAGAACCTCCTCGCTTTGCCGGAGTAGTTGTGGTAGTCTATACTTGTATCCAGCCGCGGCATGCTCGTCATCTACTATAGCCCGAAGGCTCGTCTCCGGTTCCTTAGCTTGACCTCCCAGTAGAGCTGCCTTGCTGCTGGATTGCTTGCAGGTGCCTCCAATATCTTTCCATTTGCTAGCTTTAGTAGAAGCTTGTCTCCTTGTATCCATACATCCTCGATCATGTCAAGTGAAGGATACTTCGCCTTGCCTTGTTGGTCATCCAAAAGTAGGCTTTCAGTCATAGCGTTTTGGGCACCTGCCAGTATTATCTAGATAGGGTCTACCTATATTTTGGTGTTTCGGAGGGTAAAATACTTGGGTTGTGAGGAGGCCATTTTGTGCTGATGCTTGTGTGATGAGTGGAGACCTCGCCGAACCCACCATTAGCGA
CTACCACCCCTATGCTTCGTCTGGAGAATGGGTATTCTTGCTCCGGGAATACCTAGCCAGAGCTAAACATAGCCTTTCACCATCAAGTTTATACAAACAGGCAAAAATACTCGGTGATGCATGGTATCTATACTCGCTGGCTAAGTAATACTGAGATGAGGCTCTGGGGTAGTGAAGATAAAAGGGGGGATGAAGCTTAGGTGAGAACCTCCTCGCTTTGCCGGAGTAGTTGTGGTAGTCTATACTTGTATCCAGCCGCGGCATGCTCGTCATCTACTATAGCCCGAAGGCTCGTCTCCGGTTCCTTAGCTTGACCTCCCAGTAGAGCTGCCTTGCTGCTGGATTGCTTGCAGGTGCCTCCAATATCTTTCCATTTGCTAGCTTTAGTAGAAGCTTGTCTCCTTGTATCCATACATCCTCGATCATGTCAAGTGAAGGATACTTCGCCTTGCCTTGTTGGTCATCCAAAAGTAGGCTTTCAGTCATAGCGTTTTGGGCACCTGCCAGTATTATCTAGATAGGGTCTACCTATATTTTGGTGTTTCGGAGGGTAAAATACTTGGGTTGTGAGGAGGCCATTTTGTGCTGATGCTTGTGTGATGAGTGGAGACCTCGCCGAACCCACCATTAGCGA
CTACCACCCCTATGCTTCGTCTGGAGAATGGGTATTCTTGCTCCGGGAATACCTAGCCAGAGCTAAACATAGCCTTTCACCATCAAGTTTATACAAACAGGCAAAAATACTCGGTGATGCATGGTATCTATACTCGCTGGCTAAGTAATACTGAGATGAGGCTCTGGGGTAGTGAAGATAAAAGGGGGGATGAAGCTTAGGTGAGAACCTCCTCGCTTTGCCGGAGTAGTTGTGGTAGTCTATACTTGTATCCAGCCGCGGCATGCTCGTCATCTACTATAGCCCGAAGGCTCGTCTCCGGTTCCTTAGCTTGACCTCCCAGTAGAGCTGCCTTGCTGCTGGATTGCTTGCAGGTGCCTCCAATATCTTTCCATTTGCTAGCTTTAGTAGAAGCTTGTCTCCTTGTATCCATACATCCTCGATCATGTCAAGTGAAGGATACTTCGCCTTGCCTTGTTGGTCATCCAAAAGTAGGCTTTCAGTCATAGCGTTTTGGGCACCTGCCAGTATTATCTAGATAGGGTCTACCTATATTTTGGTGTTTCGGAGGGTAAAATACTTGGGTTGTGAGGAGGCCATTTTGTGCTGATGCTTGTGTGATGAGTGGAGACCTCGCCGAACCCACCATTAGCGA
ORB
AT-rich region
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The information of repeat sequences |
Motif AKCCAAAMATASBCKDTCA
Motif ACCYVCCAKTA
Motif GRAKACYTMGCC
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The result of BLAST |
Download
|