RefSeq | NC_008553.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | aORI10010033 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 412 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.5218 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 1553449..1553860 nt | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
TGCATCCTTGGCATGGATGGTATTAAGAGTTATGGTGATCTCCCCTTTATTTCCAGTGGAAGGGGACCAACCCCTTTATTTCCAGTGGAGATTGCCATACACACCGGCAGAGAATCGTGAGCCCGTATTTGCTCAGGCTCATGAGGCCTTAGAGTGATGAACTCTGTACAACCACCACGTAGCTGGAGATCCTGTTTGAAATCGTTCAGGCTCATGAGGCCTTAGAGTGATGAACTCTGTACAACCACCACGTAGCTGGAGATCCTGTTTGAAATCGTTCAGGCTCATGAGGCCTTAGAGTGATGAGCCATGTACAACCAGCATTAATCGCCTCTACCCATATGTAAGATTGCTGATTTGCCAAATCACAGGGGGAATGCCACGACCAGTTATTCAAGCCAGCAATTCTGGA
TGCATCCTTGGCATGGATGGTATTAAGAGTTATGGTGATCTCCCCTTTATTTCCAGTGGAAGGGGACCAACCCCTTTATTTCCAGTGGAGATTGCCATACACACCGGCAGAGAATCGTGAGCCCGTATTTGCTCAGGCTCATGAGGCCTTAGAGTGATGAACTCTGTACAACCACCACGTAGCTGGAGATCCTGTTTGAAATCGTTCAGGCTCATGAGGCCTTAGAGTGATGAACTCTGTACAACCACCACGTAGCTGGAGATCCTGTTTGAAATCGTTCAGGCTCATGAGGCCTTAGAGTGATGAGCCATGTACAACCAGCATTAATCGCCTCTACCCATATGTAAGATTGCTGATTTGCCAAATCACAGGGGGAATGCCACGACCAGTTATTCAAGCCAGCAATTCTGGA
TGCATCCTTGGCATGGATGGTATTAAGAGTTATGGTGATCTCCCCTTTATTTCCAGTGGAAGGGGACCAACCCCTTTATTTCCAGTGGAGATTGCCATACACACCGGCAGAGAATCGTGAGCCCGTATTTGCTCAGGCTCATGAGGCCTTAGAGTGATGAACTCTGTACAACCACCACGTAGCTGGAGATCCTGTTTGAAATCGTTCAGGCTCATGAGGCCTTAGAGTGATGAACTCTGTACAACCACCACGTAGCTGGAGATCCTGTTTGAAATCGTTCAGGCTCATGAGGCCTTAGAGTGATGAGCCATGTACAACCAGCATTAATCGCCTCTACCCATATGTAAGATTGCTGATTTGCCAAATCACAGGGGGAATGCCACGACCAGTTATTCAAGCCAGCAATTCTGGA
ORB
AT-rich region
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The information of repeat sequences |
Motif TYGYTCAGGCTCATGAGGCCTTAGAGTGATGARCYMTGTACAACCASCA
Motif CTKKAKWTCCWGT
Motif CCWCKACC
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The result of BLAST |
Download
|