RefSeq | NC_008212.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DoriC accession number | aORI10010131 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC length | 544 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC AT content | 0.5239 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The location of oriC region | 2258065..2258608 nt | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Browse in NCBI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC map | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OriC sequences |
TCCAGAAGCGAAACAAAGCAAACGCAAGGATAATTGCTATAACAACCCCCCAGAGTGTGAATGGGATCCGTCAACGACACCCCTCGGTGTGAATGGGTGAATAGATAGCGAATTAAGATAACCACACCCACACCCCTCAGTGTGAATGGTATACCACCGCTCATACAAGATTCAATCTCTCCTGTTCAATGTTGATACGGTCACAACTGGTGACCTTACTTCACTTCGCTCAGCGACCGGCTGCGGCGCAAGCGCCTTGCCTTGTAGAGATATTTTACTTGATTAGTTGTTTATGATAATGTATAATAAAACTACCTACTGGTGTGGTAGCGGTGGCGTTGCCAGTGCAGTTGAGCACACTGGACAGACAACACAGCAACAAATACCGCCCGATGGTACGGACATCCTTGGGTATAGACAGTCAAAAGCATGTTCGAGACAGTACTGCTGTGTGTTCTCTCTTCGATTAAACCGGTGGACGAGTGTTGAGTTAGCATTATTGTGTCCTATGGTGGACCATTCACACCGAGGGGTGTGGGAGGTA
TCCAGAAGCGAAACAAAGCAAACGCAAGGATAATTGCTATAACAACCCCCCAGAGTGTGAATGGGATCCGTCAACGACACCCCTCGGTGTGAATGGGTGAATAGATAGCGAATTAAGATAACCACACCCACACCCCTCAGTGTGAATGGTATACCACCGCTCATACAAGATTCAATCTCTCCTGTTCAATGTTGATACGGTCACAACTGGTGACCTTACTTCACTTCGCTCAGCGACCGGCTGCGGCGCAAGCGCCTTGCCTTGTAGAGATATTTTACTTGATTAGTTGTTTATGATAATGTATAATAAAACTACCTACTGGTGTGGTAGCGGTGGCGTTGCCAGTGCAGTTGAGCACACTGGACAGACAACACAGCAACAAATACCGCCCGATGGTACGGACATCCTTGGGTATAGACAGTCAAAAGCATGTTCGAGACAGTACTGCTGTGTGTTCTCTCTTCGATTAAACCGGTGGACGAGTGTTGAGTTAGCATTATTGTGTCCTATGGTGGACCATTCACACCGAGGGGTGTGGGAGGTA
TCCAGAAGCGAAACAAAGCAAACGCAAGGATAATTGCTATAACAACCCCCCAGAGTGTGAATGGGATCCGTCAACGACACCCCTCGGTGTGAATGGGTGAATAGATAGCGAATTAAGATAACCACACCCACACCCCTCAGTGTGAATGGTATACCACCGCTCATACAAGATTCAATCTCTCCTGTTCAATGTTGATACGGTCACAACTGGTGACCTTACTTCACTTCGCTCAGCGACCGGCTGCGGCGCAAGCGCCTTGCCTTGTAGAGATATTTTACTTGATTAGTTGTTTATGATAATGTATAATAAAACTACCTACTGGTGTGGTAGCGGTGGCGTTGCCAGTGCAGTTGAGCACACTGGACAGACAACACAGCAACAAATACCGCCCGATGGTACGGACATCCTTGGGTATAGACAGTCAAAAGCATGTTCGAGACAGTACTGCTGTGTGTTCTCTCTTCGATTAAACCGGTGGACGAGTGTTGAGTTAGCATTATTGTGTCCTATGGTGGACCATTCACACCGAGGGGTGTGGGAGGTA
ORB
AT-rich region
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The information of repeat sequences |
Motif CAHCVACACCCCDSRGTGTGAATGG
Motif CGGYKGCGKYGCMAGYGC
Motif ACTGGTG
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The result of BLAST |
Download
|