DoriC

RefSeq

NC_007955.1

DoriC accession number

aORI10010029

OriC length

947 nt

OriC AT content

0.773

The location of oriC region

1820822..1821768 nt

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OriC map

OriC sequences

GAATTCCCTAGGTAATTACATACAACCTGTTTAAATTGATTGTGTTTAAATTTTTTATAATTTAAAAAAAGATACATTATTTATTATTAATTTTAAGTTGTTATCTTTTTTTGATAGTTTTAAAAATTTATTTGGAATATTTAAAATTAATAATAAAAATATGGTGACGTATTTTGAAAATATTCGTTTTGAGGAACTAAGAGGGTCACCCCATTGTTTCAACTGGAACATTTGAACAAGTTTTAAAATATACCTTTAAATTCCTAGAAACCTTTATTAACTATTAATTATATTCTTACAACACCTTCTTTTTTTAATATTATAAAAAATATATCTCTTATTTTTTTCTGCACTCCAGTTGAAACCATAGGGTCACGGTTCTTTATATACTTTCCAAGCGAAACTAAGGGGTGTAGTTCCAAAAGAAACTTTTTCATCACTTTTTGTTATAAACAAAATAATGTAACAAAAACATAAAAAAATCGCTTGAAAGTGGTTTTAACTTTATTTTAAATAATTTATAAAAAGTTCCAGTTGAAACAAGGGGGTATTAAGCATAACTCTTAATAAGGTACACTTCCATTGCATCAAGTGGAAAATAAGCTTTACAAAATGAACATTTTAAAGCTTCAAAAGTAATAAATAATGTCTTAAAAAGAAAATCTGAAGTTATATCATGTTAATATTTGTTCATCATGAAAAACCGAAGTTCCTTTTTTAGATATTGTTATGTATTATCATTATTTTATGTTTTAAAGTTCAGAATAAATGTGTATTACAACAATTGACATTATAAGATATCTGGATTACATAGAAGATAAAAGTTATATCTAAATAAATGTTAGTTTGATAATTTCTAAACAAATGGATTTTAAAATTTTATTATGTTAATAACAAATTCATTTGATTATTGTTAATAAGTATGAATTTATTGGAAGGTTTAAAAT

ORB AT-rich region

The information of repeat sequences

Motif TCCMRTTGAAWCAANDGG

Start	P-value		Site
530	5.43e-12	TATAAAAAGT	TCCAGTTGAAACAAGGGG	GTATTAAGCA
354	1.75e-09	TTTTCTGCAC	TCCAGTTGAAACCATAGG	GTCACGGTTC
578	2.68e-09	TAAGGTACAC	TTCCATTGCATCAAGTGG	AAAATAAGCT
393	2.92e-09	TTATATACTT	TCCAAGCGAAACTAAGGG	GTGTAGTTCC
209	4.87e-09	AAGAGGGTCA	CCCCATTGTTTCAACTGG	AACATTTGAA

Motif GTSACG

Start	P-value		Site
372	2.50e-05	AAACCATAGG	GTCACG	GTTCTTTATA
164	5.32e-05	TAAAAATATG	GTGACG	TATTTTGAAA

Motif GWAGTTCC

Start	P-value		Site
706	7.52e-06	ATGAAAAACC	GAAGTTCC	TTTTTTAGAT
413	7.52e-06	ACTAAGGGGT	GTAGTTCC	AAAAGAAACT

The result of BLAST

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subject_id	identity	aln_length	mismatches	gaps	q_start	q_end	s_start	s_end	e_value	bit_score
aORI10010029	100.0	947	0	0	1	947	1	947	0.0	1749