RefSeq GCF_000230695.2
Accession number NC_020541.1
DoriC accession number ORI97227666
OriC length 194 nt
OriC AT content 0.407216
The location of oriC region 4225462..165 nt
Browse in NCBI
OriC map
OriC sequences
rpmHGGGTTGCTCCGAAGGGAATGTGGATAAAAAGGTTGGAAAGTATGTGGGGTGAATGACACCACTGTCAAATGGCGGTGGAGGGCACCCTGTGGATACCACTGTGGATAGGTGGGCGGCCGGGGGCGTGTGGGAGGCTGCTAGACTACCCCATCACCCCGCGCGCAAGCGCTCCCAAGCTGTGGTTGATCCTATCCdnaA
rpmHGGGTTGCTCCGAAGGGAATGTGGATAAAAAGGTTGGAAAGTATGTGGGGTGAATGACACCACTGTCAAATGGCGGTGGAGGGCACCCTGTGGATACCACTGTGGATAGGTGGGCGGCCGGGGGCGTGTGGGAGGCTGCTAGACTACCCCATCACCCCGCGCGCAAGCGCTCCCAAGCTGTGGTTGATCCTATCCdnaA
rpmHGGGTTGCTCCGAAGGGAATGTGGATAAAAAGGTTGGAAAGTATGTGGGGTGAATGACACCACTGTCAAATGGCGGTGGAGGGCACCCTGTGGATACCACTGTGGATAGGTGGGCGGCCGGGGGCGTGTGGGAGGCTGCTAGACTACCCCATCACCCCGCGCGCAAGCGCTCCCAAGCTGTGGTTGATCCTATCCdnaA
rpmHGGGTTGCTCCGAAGGGAATGTGGATAAAAAGGTTGGAAAGTATGTGGGGTGAATGACACCACTGTCAAATGGCGGTGGAGGGCACCCTGTGGATACCACTGTGGATAGGTGGGCGGCCGGGGGCGTGTGGGAGGCTGCTAGACTACCCCATCACCCCGCGCGCAAGCGCTCCCAAGCTGTGGTTGATCCTATCCdnaA
rpmHGGGTTGCTCCGAAGGGAATGTGGATAAAAAGGTTGGAAAGTATGTGGGGTGAATGACACCACTGTCAAATGGCGGTGGAGGGCACCCTGTGGATACCACTGTGGATAGGTGGGCGGCCGGGGGCGTGTGGGAGGCTGCTAGACTACCCCATCACCCCGCGCGCAAGCGCTCCCAAGCTGTGGTTGATCCTATCCdnaA
rpmHGGGTTGCTCCGAAGGGAATGTGGATAAAAAGGTTGGAAAGTATGTGGGGTGAATGACACCACTGTCAAATGGCGGTGGAGGGCACCCTGTGGATACCACTGTGGATAGGTGGGCGGCCGGGGGCGTGTGGGAGGCTGCTAGACTACCCCATCACCCCGCGCGCAAGCGCTCCCAAGCTGTGGTTGATCCTATCCdnaA
rpmHGGGTTGCTCCGAAGGGAATGTGGATAAAAAGGTTGGAAAGTATGTGGGGTGAATGACACCACTGTCAAATGGCGGTGGAGGGCACCCTGTGGATACCACTGTGGATAGGTGGGCGGCCGGGGGCGTGTGGGAGGCTGCTAGACTACCCCATCACCCCGCGCGCAAGCGCTCCCAAGCTGTGGTTGATCCTATCCdnaA
rpmhGGGTTGCTCCGAAGGGAATGTGGATAAAAAGGTTGGAAAGTATGTGGGGTGAATGACACCACTGTCAAATGGCGGTGGAGGGCACCCTGTGGATACCACTGTGGATAGGTGGGCGGCCGGGGGCGTGTGGGAGGCTGCTAGACTACCCCATCACCCCGCGCGCAAGCGCTCCCAAGCTGTGGTTGATCCTATCCdnaa
rpmHGGGTTGCTCCGAAGGGAATGTGGATAAAAAGGTTGGAAAGTATGTGGGGTGAATGACACCACTGTCAAATGGCGGTGGAGGGCACCCTGTGGATACCACTGTGGATAGGTGGGCGGCCGGGGGCGTGTGGGAGGCTGCTAGACTACCCCATCACCCCGCGCGCAAGCGCTCCCAAGCTGTGGTTGATCCTATCCdnaA
rpmHGGGTTGCTCCGAAGGGAATGTGGATAAAAAGGTTGGAAAGTATGTGGGGTGAATGACACCACTGTCAAATGGCGGTGGAGGGCACCCTGTGGATACCACTGTGGATAGGTGGGCGGCCGGGGGCGTGTGGGAGGCTGCTAGACTACCCCATCACCCCGCGCGCAAGCGCTCCCAAGCTGTGGTTGATCCTATCCdnaA
rpmHGGGTTGCTCCGAAGGGAATGTGGATAAAAAGGTTGGAAAGTATGTGGGGTGAATGACACCACTGTCAAATGGCGGTGGAGGGCACCCTGTGGATACCACTGTGGATAGGTGGGCGGCCGGGGGCGTGTGGGAGGCTGCTAGACTACCCCATCACCCCGCGCGCAAGCGCTCCCAAGCTGTGGTTGATCCTATCCdnaA
5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif CTGTGGAT

StartP-valueSite
991.74e-05GTGGATACCACTGTGGATAGGTGGGCGG
871.74e-05GGAGGGCACCCTGTGGATACCACTGTGG
1774.95e-05CGCTCCCAAGCTGTGGTTGATCCTATCC
184.95e-05TCCGAAGGGAATGTGGATAAAAAGGTTG

Motif AYBACMCC

StartP-valueSite
1501.10e-05AGACTACCCCATCACCCCGCGCGCAAGC
1423.62e-05AGGCTGCTAGACTACCCCATCACCCCGC
535.16e-05TGTGGGGTGAATGACACCACTGTCAAAT

Motif GMTCCBAW

StartP-valueSite
1681.70e-05GCGCGCAAGCGCTCCCAAGCTGTGGTTG
64.57e-05GGGTTGCTCCGAAGGGAATGTGG
1859.56e-05AGCTGTGGTTGATCCTATCC
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score