RefSeq GCF_000155675.2
Accession number NC_020911.1
DoriC accession number ORI97227670
OriC length 552 nt
OriC AT content 0.51087
The location of oriC region 4812149..100 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif ACCGAWYCTM

StartP-valueSite
2971.22e-06ACGGTCTTGAACCGAACCTCGTTTGATACA
2551.93e-06CAAGGAAACGACCGAATCTACACCATAGTG
132.70e-06TTCGGTCTTTACCGATTCTCAACATTCATT

Motif KGCGGCSCCDGCNGVTYGNGT

StartP-valueSite
1767.23e-09CAGTTGAAATTGCAGCCCCTGCAGGTCTAGTTTTACAGAGC
3739.75e-09TCACGCTATCTGCGACGCCAGCTGATTGAGGGGAAAATTCT
4371.07e-08TCAGTGTTAGGACGGCGCCGTCACATCGTGTTTTGTGGCGT
5083.90e-08TGACGACAATGGCGGTGGCAGCCGCTTGGGTACCTGTGGGA
401.02e-07ATTGATTTAGGGCGGCCCAGACGGGCCGCCTTTTTGTTTTC

Motif ACGACAA

StartP-valueSite
5004.22e-05ATGTAGTGTGACGACAATGGCGGTGGC
3504.22e-05ACCTTGCTGAACGACAACGTGGCTCAC
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score