RefSeq GCF_000146065.2
Accession number NC_020449.1
DoriC accession number ORI97010114
OriC length 1010 nt
OriC AT content 0.69901
The location of oriC region 2245811..2246820 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif CTYTTSTTCYC

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1606.12e-08TTTTTATTTCCCCTTCTTCCCTAATAGCATT
3492.55e-07TCGGCGTTCTCTTTTCTTCCCCGATTATATA
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4682.86e-06CTGATATCGGCTTTTGTTCTCTTTACAATAT
1889.24e-06ATTGCTTACTCATTGCTTACCCATTGCTAAT

Motif TCCKWAATGAG

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2241.51e-07CCGTAATGAGTCCGTAATGAGTAAGCAATGC
2131.51e-07GCTAATGCCATCCGTAATGAGTCCGTAATGA
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Motif ATCGGS

StartP-valueSite
9076.21e-05TGTCTATTTTATCGGCATAACTTATT
3386.21e-05TAATCTGATTATCGGCGTTCTCTTTT
8731.37e-04TTGTGGATAAATCGGGTTTAGGTAGT
6631.37e-04ATATAGAAAAATCGGGATTAGAATTC

Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score
ORI94010903 100.0 1010 0 0 1 1010 1 1010 0.0 1866