RefSeq GCF_000160335.2
Accession number NC_022113.1
DoriC accession number ORI97227916
OriC length 277 nt
OriC AT content 0.0
The location of oriC region 1906..2182 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif GTRKVWAAMTTHGSVAAAYBYAWTYTKTT

StartP-valueSite
813.53e-13ATATGCTAATGTGGCAAGATGAGCAAAACTCATTTTGTGGATAATGTTT
13.53e-13.GTAGGAAACTTTGGGAAATGTAATCTGTTATATAACAGT
1551.44e-12TTATCAACATGTGTATAACTTCGCCAAATCTATGTTTTTAAGACTTATC

Motif CSACWGS

StartP-valueSite
2567.84e-06TATATATAAACGACTGGAAGGAGTTTT
2018.63e-05ATCCACCAATCCACAGCACCTACTACT

Motif GYCATAC

StartP-valueSite
1332.81e-05AGTCATACACGCCATACACAAGTTATC
1248.32e-05ATGTTTAAAAGTCATACACGCCATACA
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score