DoriC

RefSeq

GCF_000158275.2

Accession number

NZ_CP007062.1

DoriC accession number

ORI97024713

OriC length

631 nt

OriC AT content

0.876387

The location of oriC region

2507143..53 nt

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OriC map

OriC sequences

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5'-DnaA box-3' 3'-DnaA box-5' Spacer DnaA-trio ATP-DnaA box
AT-rich region GATC CtrA binding motif Fis binding site IHF binding site

The information of repeat sequences

Motif YAMYTCC

Start	P-value		Site
11	7.23e-08	AAAATATATT	CACCTCC	AAAAAACTAC
481	6.36e-05	GACAAAAATT	TAATTCC	AGTAAATTTT

Motif GRRGAG

Start	P-value		Site
620	9.08e-07	CATATTATAT	GGGGAG	TTTGAA
190	3.87e-05	GAATTTATTT	GAAGAG	AGATGTGAAA

Motif GACAAWM

Start	P-value		Site
165	1.20e-05	AAAATTAAAA	GACAATC	AAAATTTAGA
471	5.60e-05	TTATTTAGTA	GACAAAA	ATTTAATTCC

Distribution of genes on leading or lagging strand

Distribution of nucleotide on leading or lagging strand

The result of BLAST

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