RefSeq GCF_000153405.2
Accession number NC_020802.1
DoriC accession number ORI97227381
OriC length 361 nt
OriC AT content 0.711911
The location of oriC region 46195..46555 nt
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OriC map
OriC sequences
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5'-DnaA box-3'      3'-DnaA box-5'     Spacer     DnaA-trio            ATP-DnaA box
AT-rich region     GATC   CtrA binding motif     Fis binding site     IHF binding site
The information of repeat sequences

Motif RCACAGS

StartP-valueSite
2787.00e-06CCAAAGTTAAGCACAGGTTTATGCATA
2621.43e-05GGCTACTTATGCACAGCCAAAGTTAAG
3343.07e-05AATGATATATACACAGGCTACTGTGTA

Motif AAGATC

StartP-valueSite
1952.94e-04GATCTTATATAAGATCCTTTGTTGTG
1772.94e-04TTTTATTTTAAAGATCAGGATCTTAT
1122.94e-04TAGATCTTTAAAGATCTTTTATTACT
712.94e-04TGACACCACTAAGATCAAATGAATAG
1834.18e-04TTTAAAGATCAGGATCTTATATAAGA

Motif GWWTGGC

StartP-valueSite
2481.77e-05CCTTGGGATAGAATGGCTACTTATGCA
1407.99e-05TATTATTAATGTTTGGCTCTTTTATGT
Distribution of genes on leading or lagging strand
Distribution of nucleotide on leading or lagging strand
The result of BLAST Download

subject_id identity aln_length mismatches gaps q_start q_end s_start s_end e_value bit_score